Metilmalonil-CoA mutase - Methylmalonyl-CoA mutase

MMUT
Protein MUT PDB 2XIJ.png
Estruturas disponíveis
PDB Pesquisa Ortholog: PDBe RCSB
Identificadores
Apelido MMUT , MCM, metilmalonil-CoA mutase, metilmalonil coenzima-A mutase, MUT
IDs externos OMIM : 609058 MGI : 97239 HomoloGene : 20097 GeneCards : MMUT
Ortólogos
Espécies Humano Mouse
Entrez
Conjunto
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_000255

NM_008650

RefSeq (proteína)

NP_000246
NP_000246.2

NP_032676

Localização (UCSC) Chr 6: 49,43 - 49,46 Mb Chr 17: 40,93 - 40,96 Mb
Pesquisa PubMed
Wikidata
Ver / Editar Humano Ver / Editar Mouse
metilmalonil-CoA mutase
Identificadores
EC nº 5.4.99.2
CAS no. 9023-90-9
Bancos de dados
IntEnz Vista IntEnz
BRENDA Entrada BRENDA
ExPASy NiceZyme view
KEGG Entrada KEGG
MetaCyc via metabólica
PRIAM perfil
Estruturas PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Ontologia Genética AmiGO / QuickGO

Metilmalonil-CoA mutase (MCM), mitocondrial , também conhecida como metilmalonil-CoA isomerase , é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene MUT . Esta vitamina B 12 enzima dependente catalisa a isomerização de metilmalonil-CoA para succinil-CoA-redutase nos seres humanos. Mutações no gene MUT podem levar a vários tipos de acidúria metilmalônica .

MCM foi identificado pela primeira vez em fígado de rato e rim de ovelha em 1955. Em sua forma latente, tem 750 aminoácidos de comprimento. Após a entrada na mitocôndria, a sequência líder mitocondrial de 32 aminoácidos no terminal N da proteína é clivada, formando o monômero totalmente processado. Os monômeros então se associam em homodímeros e ligam AdoCbl (um para cada sítio ativo do monômero) para formar a forma de holoenzima ativa final .

Estrutura

Gene

O gene MUT está localizado no cromossomo 6p12.3 e consiste em 13 exons , medindo mais de 35kb.

Proteína

A enzima madura é um homodímero com o domínio de ligação de CoA N-terminal e o domínio de ligação de cobalamina C-terminal.

Função

A metilmalonil-CoA mutase é expressa em altas concentrações no rim , em concentrações intermediárias no coração , ovários , cérebro , músculos e fígado e em baixas concentrações no baço . A enzima pode ser encontrada em todo o sistema nervoso central (SNC). MCM reside na mitocôndria, onde uma série de substâncias, incluindo os aminoácidos de cadeia ramificada isoleucina e valina , bem como metionina , treonina , timina e ácidos graxos de cadeia ímpar , são metabolizados via semialdeído de metilmalonato (MMlSA) ou propionil-CoA (Pr-CoA) a um composto comum - metilmalonil-CoA (MMl-CoA). MCM catalisa a isomerização reversível de l-metilmalonil-CoA em succinil-CoA, requerendo cobalamina (vitamina B12) na forma de adenosilcobalamina (AdoCbl) como cofator. Como uma etapa importante no catabolismo do propionato, essa reação é necessária para a degradação dos ácidos graxos de cadeia ímpar , os aminoácidos valina , isoleucina , metionina e treonina e colesterol , canalizando metabólitos da decomposição desses aminoácidos em ácido tricarboxílico ciclo .

A mutase de metilmalonil-CoA catalisa a seguinte reação:

L-metilmalonil-CoA metilmalonil-CoA mutase Succinil-CoA
L-metilmalonil-CoA.png   Succinyl-CoA.png
Seta de reação bioquímica reversível NNNN horiz med.svg
 
  metilmalonil-CoA mutase


O substrato da metilmalonil-CoA mutase, metilmalonil-CoA , é principalmente derivado de propionil-CoA , uma substância formada a partir do catabolismo e da digestão de isoleucina , valina , treonina , metionina , timina , colesterol ou ácidos graxos de cadeia ímpar. O produto da enzima, succinil-CoA , é uma molécula chave do ciclo do ácido tricarboxílico .

Significado clínico

A deficiência dessa enzima é responsável por um distúrbio hereditário do metabolismo, deficiência da metilmalonil-CoA mutase , que é uma das causas da acidemia metilmalônica (também conhecida como acidúria metilmalônica ou MMA). O MMA é um erro inato hereditário autossômico recessivo do metabolismo, caracterizado por episódios recorrentes de vômitos, letargia, cetoacidose profunda , hiperamonemia e pancitopenia na infância e pode causar morte precoce. As complicações incluem cardiomiopatia , acidente vascular cerebral metabólico , pancreatite e insuficiência renal progressiva .

As mutações no gene MUT (codifica a metilmalonil-CoA mutase) ou MMAA (codifica uma proteína chaperona da metilmalonil-CoA mutase, proteína MMAA ) podem levar à acidemia da metilmalonil. Mutações em MUT podem ser categorizadas como MUT 0 (não demonstra atividade mesmo na presença de excesso de AdoCbl) ou MUT 1 (demonstra atividade muito baixa na presença de excesso de AdoCbl). Mais da metade das mutações de MUT são mutações sem sentido, enquanto as mutações sem sentido compreendem uma fração restante significativa (aproximadamente 14%)

Os métodos de tratamento comuns para MMA incluem um transplante de fígado ou um transplante de fígado e rim para combater a doença renal da acidemia metilmalônica. No entanto, os efeitos neurológicos prejudiciais podem continuar a atormentar os pacientes, mesmo após uma operação bem-sucedida. Pensa-se que isto se deve à presença generalizada de metilmalonil-CoA mutase em todo o sistema nervoso central. Devido à perda de funcionalidade da enzima, os níveis de substrato se acumulam no SNC. O substrato, L-metilmalonil-CoA hidrolisa para formar metilmalonato (ácido metilmalônico), um ácido dicarboxílico neurotóxico que, devido às fracas capacidades de transporte de ácido dicarboxílico da barreira hematoencefálica, é efetivamente preso dentro do SNC, levando à debilitação neurológica. Para combater esses efeitos, regimes anti-catabólicos perioperatórios e nenhuma interrupção da dieta são recomendados.

O modelo murino provou ser uma forma adequada e precisa de estudar os efeitos do MMA e os métodos de tratamento potenciais.

Mecanismo

Mecanismo de reação do MCM

O mecanismo de reação MCM começa com a clivagem homolítica da ligação C- Co (III) do AdoB12 , os átomos C e Co cada um adquire um dos elétrons que formaram a ligação do par de elétrons clivado. O íon Co, portanto, flutua entre seus estados de oxidação Co (III) e Co (II) [os dois estados são espectroscopicamente distinguíveis: Co (III) é vermelho e diamagnético (sem elétrons desemparelhados), enquanto Co (II) é amarelo e paramagnético (elétrons desemparelhados)]. Conseqüentemente, o papel da coenzima B-12 no processo catalítico é o de um gerador reversível de um radical livre . A ligação C-Co (III) é fraca, com uma energia de dissociação = 109 kJ / mol, e parece ser ainda mais enfraquecida por meio de interações estéricas com a enzima. A reação homolítica é incomum na biologia, assim como a presença de uma ligação metal-carbono.

Metilmalonil-CoA mutase é um membro da subfamília isomerase de enzimas dependentes de adenosilcobalaminas. Além disso, é classificado como classe I, pois é uma enzima 'DMB-off' / 'His-on'. Isso se refere à natureza do cofator AdoCbl no sítio ativo do metilmalonil CoA. AdoCbl é composto por um anel corrin contendo cobalto central , um ligante axial superior (ligante axial β) e um ligante axial inferior (ligante axial α). Na metilmalonil-CoA mutase, o ligante β-axial 5'-desoxi-5'-adenosina dissocia-se reversivelmente para dar o radical desoxiadenosil . O ligante α-axial 5,6-dimetilbenzimidazol (DMB) está envolvido na organização do sítio ativo para permitir que a histidina -610 se ligue com Co, em vez de DMB (a razão para a notação 'DMB-off' / 'His-on' ) A ligação do resíduo de histidina-610 aumenta a taxa de quebra da ligação do ligante β-axial homolítico - Co por um fator de 10 12 .

Site ativo MCM. Anel de Corrin e ligante α-axial (DMB): (amarelo), ligante β-axial: (verde), substrato / produto: (ciano), resíduos interagindo com o ligante β-axial: glu370, asn366, gly91, ala139 (azul) , resíduos interagindo com o substrato: gln197, his244, arg207, tyr89 (vermelho) e his610: (laranja). Renderizado em PDB 4REQ.

Outros resíduos importantes da metilmalonil-CoA mutase incluem Histidina-244, que atua como um ácido geral próximo ao substrato e protege as espécies radicais de reações colaterais envolvendo oxigênio, Glutamato -370, cuja ligação de hidrogênio com o grupo 2'-OH da ribose do ligando axial β força a interação entre as espécies de radicais do ligante axial β e o substrato, e tirosina -89 que estabiliza intermediários de radicais reativos e é responsável pela estereosseletividade da enzima.

A proteína de processamento, a proteína MMAA , desempenha o importante papel de auxiliar no carregamento e na troca de cofator. A proteína MMAA favorece a associação com a apoenzima MCM e permite a transferência do cofator AdoCbl para o sítio ativo da enzima. Além disso, se o AdoCbl ligado acumula dano oxidativo durante o funcionamento normal, a proteína MMAA promove a troca do cofator danificado por um novo AdoCbl por meio de uma via dependente de GTP .

Interações

Referências

Leitura adicional

links externos