Gene doméstico - Housekeeping gene
Em biologia molecular , os genes de manutenção são tipicamente genes constitutivos que são necessários para a manutenção da função celular básica e são expressos em todas as células de um organismo em condições normais e patofisiológicas. Embora alguns genes de manutenção sejam expressos em taxas relativamente constantes na maioria das situações não patológicas, a expressão de outros genes de manutenção pode variar dependendo das condições experimentais.
A origem do termo "gene de manutenção" permanece obscura. A literatura de 1976 usou o termo para descrever especificamente tRNA e rRNA . Para fins experimentais, a expressão de um ou vários genes de manutenção é usada como ponto de referência para a análise dos níveis de expressão de outros genes. O critério-chave para o uso de um gene de manutenção dessa maneira é que o gene de manutenção escolhido seja expresso de maneira uniforme com baixa variância sob as condições de controle e experimentais. A validação de genes de manutenção deve ser realizada antes de seu uso em experimentos de expressão gênica, como RT-PCR . Recentemente, um banco de dados baseado na web de genes domésticos e genes de referência / transcrições de humanos e camundongos , chamado Housekeeping and Reference Transcript Atlas (HRT Atlas), foi desenvolvido para oferecer uma lista atualizada de genes de limpeza e genes candidatos confiáveis / transcritos de referência para dados RT-qPCR normalização. Esse banco de dados pode ser acessado em http://www.housekeeping.unicamp.br .
Regulação do gene doméstico
Os genes domésticos são responsáveis pela maioria dos genes ativos no genoma e sua expressão é obviamente vital para a sobrevivência. Os níveis de expressão do gene de manutenção são ajustados para atender aos requisitos metabólicos em vários tecidos. Os estudos bioquímicos sobre a iniciação da transcrição dos promotores do gene doméstico têm sido difíceis, em parte devido aos motivos promotores menos caracterizados e ao processo de iniciação da transcrição.
Os promotores de genes de manutenção humana são geralmente depletados de TATA- box, têm alto conteúdo de GC e alta incidência de ilhas CpG . Em Drosophila, onde as ilhas CpG específicas do promotor estão ausentes, os promotores do gene de manutenção contêm elementos de DNA como DRE, E-box ou DPE. Os locais de início da transcrição de genes de manutenção podem se estender por uma região de cerca de 100 bp, enquanto os locais de início da transcrição de genes regulados pelo desenvolvimento geralmente se concentram em uma região estreita. Pouco se sabe sobre como a iniciação da transcrição dispersa do gene housekeeping é estabelecida. Existem fatores de transcrição que são especificamente enriquecidos e regulam os promotores do gene doméstico. Além disso, os promotores de tarefas domésticas são regulados por intensificadores de tarefas domésticas, mas não por aprimoradores regulados pelo desenvolvimento.
Genes domésticos comuns em humanos
A seguir está uma lista parcial de "genes de manutenção". Para uma lista mais completa e atualizada, consulte o banco de dados HRT Atlas compilado por Bidossessi W. Hounkpe et al. O banco de dados foi construído minerando mais de 12.000 conjuntos de dados de RNA-seq humanos e de camundongo.
Expressão genetica
Fatores de transcrição
- ATF1 NM_005171
- ATF2 NM_001880
- ATF4 ativando o fator de transcrição 4 NM_001675
- ATF6 NM_007348
- ATF7 NM_001206682
- ATF7IP NM_018179
- BTF3 NM_001207 Homo sapiens fator de transcrição básico 3
- E2F4 Homo sapiens E2F fator de transcrição 4, ligação de p107 / p130 (E2F4), mRNA
- ERH (gene) Enhancer de homólogo rudimentar de drosophila (que por sua vez é a primeira etapa enzimática na síntese de pirimidina. Regulado por MITF)
- Caixa de grupo de alta mobilidade HMGB1 liga DNA
- ILF2 Homo sapiens fator de ligação 2 do intensificador de interleucina, 45kDa (ILF2), mRNA
- IER2 anteriormente ETR101 Immediate Early Protein?
- JUND Homo sapiens jun D proto-oncogene (JUND), mRNA
- TCEB2 Elongin Matheo er rar
Repressores
- PUF60 Homo sapiens que interage com a proteína de ligação ao fusível (SIAHBP1), transcrito
Splicing de RNA
- BAT1 também conhecido como DDX39B
- HNRPD Homo sapiens heterogêneo nuclear ribonucleoproteína D (RNA de elemento rico em AU
- HNRPK Homo sapiens heterogêneo ribonucleoproteína K nuclear (HNRPK), transcrito
- Proteína de ligação de PABPN1 poli (A), nuclear 1
- Fator de splicing SRSF3 , rico em arginina / serina
Fatores de tradução
- EIF1 também conhecido como SUI1
- EIF1AD
- EIF1B
- EIF2A
- EIF2AK1
- EIF2AK3
- EIF2AK4
- EIF2AK1
- EIF2B2
- EIF2B3
- EIF2B4
- EIF2S2
- EIF3A
- EIF3B
- EIF3D anteriormente EIF3S4
- EIF3G
- EIF3I
- EIF3H
- EIF3J
- EIF3K
- EIF3L
- EIF3M
- EIF3S5
- EIF3S8
- EIF4A1
- EIF4A2
- EIF4A3
- EIF4E2
- EIF4G1
- EIF4G2
- EIF4G3
- EIF4H
- EIF5
- EIF5
- EIF5A
- EIF5AL1
- EIF5B
- EIF6
- Fator de alongamento translacional TUFM Tu mitocondrial
síntese de tRNA
- AARS NM_001605 alanil-tRNA sintetase
- AARS2 NM_020745 alanil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- AARSD1 NM_001261434 alanil-tRNA sintetase domínio contendo 1
- CARS NM_001751 cisteinil-tRNA sintetase
- CARS2 NM_024537 cisteinil-tRNA sintetase 2, mitocondrial (putativo)
- DARS NM_001349 aspartil-tRNA sintetase
- DARS2 NM_018122 aspartil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- EARS2 NM_001083614 glutamil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- FARS2 NM_006567 fenilalanil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- FARSA NM_004461 fenilalanil-tRNA sintetase, subunidade alfa
- FARSB NM_005687 fenilalanil-tRNA sintetase, subunidade beta
- GARS NM_002047 glicil-tRNA sintetase
- HARS NM_002109 histidil-tRNA sintetase
- HARS2 NM_012208 histidil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- IARS NM_002161 isoleucil-tRNA sintetase
- IARS2 NM_018060 isoleucil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- KARS NM_005548 Homo sapiens lisil-tRNA sintetase (KARS), mRNA
- LARS2 NM_015340 isoleucil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- MARS NM_004990 metionil-tRNA sintetase
- MARS2 NM_138395 metionil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- NARS NM_004539 asparaginil-tRNA sintetase
- NARS2 NM_024678 asparaginil-tRNA sintetase 2, mitocondrial (putativo)
- QARS NM_005051 glutaminil-tRNA sintetase
- ARSA NM_002884 arginil-tRNA sintetase
- RARS2 NM_020320 arginil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- SARS NM_006513 Homo sapiens seril-tRNA sintetase (SARS), mRNA
- TARS NM_152295 treonil-tRNA sintetase
- VARS2 NM_020442 valil-tRNA sintetase 2, mitocondrial
- WARS2 NM_015836 triptofanil tRNA sintetase 2, mitocondrial
- YARS NM_003680 Homo sapiens tirosil-tRNA sintetase (YARS), mRNA
- YARS2 NM_001040436 Homo sapiens tirosil-tRNA sintetase (YARS), mRNA mitocondrial
Proteína de ligação a RNA
Proteínas ribossomais
- RPL5
- RPL8
- RPL9
- RPL10A
- RPL11
- RPL14
- RPL25
- RPL26L1
- RPL27
- RPL30
- RPL32
- RPL34
- RPL35
- RPL35A
- RPL36AL
- RPS5
- RPS6
- RPS6KA3
- RPS6KB1
- RPS6KB2
- RPS13
RPS19BP1
- RPS20
- RPS23
- RPS24
- RPS27 transcrito com ubiquitina (ver FAU (gene) )
- RPN1 Ribophorin ancora o ribossomo ao retículo endoplasmático rugoso
Proteínas ribossomais mitocondriais
- MRPL9
- MRPL1
- MRPL10
- MRPL11
- MRPL12
- MRPL13
- MRPL14
- MRPL15
- MRPL16
- MRPL17
- MRPL18
- MRPL19
- MRPL2
- MRPL20
- MRPL21
- MRPL22
- MRPL23
- MRPL24
- MRPL27
- MRPL28
- MRPL3
- MRPL30
- MRPL32
- MRPL33
- MRPL35
- MRPL36
- MRPL37
- MRPL38
- MRPL4
- MRPL40
- MRPL41
- MRPL42
- MRPL43
- MRPL44
- MRPL45
- MRPL46
- MRPL47
- MRPL48
- MRPL49
- MRPL50
- MRPL51
- MRPL52
- MRPL53
- MRPL54
- MRPL55
- MRPL9
- MRPS10
- MRPS11
- MRPS12
- MRPS14
- MRPS15
- MRPS16
- MRPS17
- MRPS18A
- MRPS18B
- MRPS18C
- MRPS2
- MRPS21
- MRPS22
- MRPS23
- MRPS24
- MRPS25
- MRPS26
- MRPS27
- MRPS28
- MRPS30
- MRPS31
- MRPS33
- MRPS34
- MRPS35
- MRPS5
- MRPS6
- MRPS7
- MRPS9
RNA polimerase
Processamento de proteínas
- PPID Peptidil-prolil cis-trans isomerase D
- PPIE Peptidil-prolil cis-trans isomerase E
- PPIF Peptidil-prolil cis-trans isomerase F
- PPIG Peptidil-prolil cis-trans isomerase G
- PPIH Ciclofilina H
- CANX Calnexin. Dobramento de glicoproteínas dentro do retículo endoplasmático
- CAPN1 subunidade Calpain
- CAPN7
- Subunidade de protease CAPNS1 Calpain
- NACA polipeptídeo nascente associado a polipeptídeo alfa complexo
- NACA2
- PFDN2 Prefoldina 2
- PFDN4 Prefoldina 4
- PFDN5 Prefoldina 5
- PFDN6 Prefoldina 6
- SNX2 Sorting nexin 2
- SNX3 Sorting nexin 3
- SNX4 Sorting nexin 4
- SNX5 Sorting nexin 5
- SNX6 Sorting nexin 6
- SNX9 Classificação nexin 9
- SNX12 Sorting nexin 12
- SNX13 Classificando nexin 13
- SNX17 Classificação nexin 17
- SNX18 Classificando nexin 18
- SNX19 Classificação nexin 19
- SNX25 Sorting nexin 25
- Proteína TRAPA associada a translocon de SSR1 . Translocação de proteína em ER
- Proteína TRAPB associada a translocon de SSR2 . Translocação de proteína em ER
- Proteína SSR3 associada a translocon TRAPG. Translocação de proteína em ER
- Direcionamento de proteína SUMO1
- Direcionamento de proteína SUMO3
Proteínas de choque térmico
Histona
Ciclo de célula
Há uma sobreposição significativa na função com relação a algumas dessas proteínas. Em particular, os genes relacionados a Rho são importantes no tráfico nuclear (ou seja: mitose), bem como na mobilidade ao longo do citoesqueleto em geral. Esses genes são de particular interesse na pesquisa do câncer.
- ARHGAP35
- ARHGAP5
- ARHGDIA
- Fator de troca de nucleotídeo de guanina ARHGEF10L Rho 10L
- Fator de troca 11 de nucleotídeo de guanina ARHGEF11 Rho
- ARHGEF40 Fator de troca de nucleotídeo de guanina Rho 40
- Fator de troca de nucleotídeo de guanina ARHGEF7 Rho 7
- RAB10 NM_016131 As pequenas GTPases Rab são reguladoras chave do tráfego da membrana intracelular, desde a formação das vesículas de transporte até a sua fusão com as membranas
- RAB11A NM_004663
- RAB11B NM_004218
- RAB14 NM_016322
- RAB18 NM_021252
- RAB1A NM_004161 Homo sapiens RAB1A, membro da família de oncogene RAS (RAB1A), mRNA
- RAB1B NM_030981
- RAB21 NM_014999
- RAB22A NM_020673
- RAB2A NM_002858
- RAB2B NM_001163380
- RAB3GAP1 NM_012233
- RAB3GAP2 NM_012414
- RAB40C NM_021168
- RAB4A NM_004578
- RAB5A NM_004162
- RAB5B NM_002865
- RAB5C NM_004583
- RAB6A NM_002868
- RAB7A NM_004637
- RAB9A NM_004251
- RABEP1 NM_004703
- RABEPK NM_005833
- RABGEF1 NM_014504
- RABGGTA NM_004581
- RABGGTB NM_004582
- Proteína B do centrômero CENPB
- CTBP1 Centromere proteína T
- CCNB1IP1 NM_021178 E3 ubiquitina-proteína ligase. Modula os níveis de ciclina B e participa da regulação da progressão do ciclo celular através da fase G2
- CCNDBP1 NM_012142 Pode regular negativamente a progressão do ciclo celular
- CCNG1 NM_004060 Pode desempenhar um papel na regulação do crescimento
- CCNH NM_001239 Envolvido no controle do ciclo celular e na transcrição do RNA pela RNA polimerase II. Sua expressão e atividade são constantes ao longo do ciclo celular
- CCNK NM_001099402 Subunidade reguladora de quinases dependentes de ciclina que medeia a fosforilação da subunidade grande da RNA polimerase II
- CCNL1 NM_020307 Regulador transcricional que participa na regulação do processo de splicing pré-mRNA
- CCNL2 NM_030937 Regulador transcricional que participa na regulação do processo de splicing pré-mRNA. Também modula a expressão do fator apoptótico crítico, levando à apoptose celular.
- CCNY NM_145012 Subunidade reguladora positiva das cinases dependentes de ciclina CDK14 / PFTK1 e CDK16. Atua como um regulador do ciclo celular da via de sinalização Wnt durante a fase G2 / M
- PPP1CA NM_002708 Fosfatase de proteína que se associa a mais de 200 proteínas regulatórias para formar holoenzimas altamente específicas que desfosforilam centenas de alvos biológicos
- PPP1CC NM_002710
- PPP1R10 NM_002714
- PPP1R11 NM_021959 Homo sapiens proteína fosfatase 1, reguladora (inibidor) subunidade 11 (PPP1R11),
- PPP1R15B NM_032833
- PPP1R37 NM_019121
- PPP1R7 NM_002712
- PPP1R8 NM_002713
- PPP2CA NM_002715
- PPP2CB NM_001009552
- PPP2R1A NM_014225 Regulador negativo de crescimento e divisão celular Fosfatase 2 da proteína homo sapiens (anteriormente 2A), subunidade reguladora A (PR 65),
- PPP2R2A NM_002717
- PPP2R2D NM_018461
- PPP2R3C NM_017917
- PPP2R4 NM_021131
- PPP2R5A NM_006243
- PPP2R5B NM_006244
- PPP2R5C NM_002719
- PPP2R5D NM_006245
- PPP2R5E NM_006246
- PPP4C NM_002720
- PPP4R1 NM_005134
- PPP4R2 NM_174907
- PPP5C NM_006247
- PPP6C NM_002721
- PPP6R2 NM_014678
- PPP6R3 NM_018312
- RAD1Homo sapiens ribonuclease / inibidor de angiogenina (RNH), mRNA
- RAD17 NM_002869 Essencial para o crescimento celular sustentado, manutenção da estabilidade cromossômica e ativação de checkpoint dependente de ATR após dano ao DNA
- RAD23B NM_002873
- RAD50 NM_005732
- RAD51C NM_002874
- IST1 (localiza na linha divisória central das células em divisão)
Apoptose
- DAD1 Defensor contra a morte celular
- DAP3 Envolvido na mediação da morte celular induzida por interferon-gama.
- Proteína 6 associada à morte DAXX
Oncogenes
- ARAF
- MAZ (gene)
- MYC também é considerado um fator de transcrição
Reparo / replicação de DNA
- MCM3AP possivelmente um primase
- XRCC5 NM_021141 Ku80
- XRCC6 NM_001469 Autoantígeno tireoidiano de Homo sapiens: Helicase dependente de ATP dependente de DNA de fita simples. Tem um papel na translocação de cromossomos.
Metabolismo
- PRKAG1 detecta o nível de energia e inativa a HMGCoA redutase e a Acetil CoA Carboxilase
- PRKAA1 NM_006251 Subunidade catalítica da proteína quinase ativada por AMP (AMPK), uma proteína quinase de sensor de energia que desempenha um papel fundamental na regulação do metabolismo de energia celular
- PRKAB1 NM_006253 Subunidade não catalítica da proteína quinase ativada por AMP (AMPK), uma proteína quinase de sensor de energia que desempenha um papel fundamental na regulação do metabolismo de energia celular
- PRKACA NM_002730 Fosforila um grande número de substratos no citoplasma e no núcleo.
- PRKAG1 NM_002733 Homo sapiens proteína quinase, ativada por AMP, subunidade não catalítica gama 1 (PRKAG1), mRNA
- PRKAR1A NM_002734 Subunidade reguladora das proteínas quinases dependentes de cAMP envolvidas na sinalização de cAMP em células
- PRKRIP1 NM_024653 Liga o RNA de fita dupla. Inibe a atividade da quinase EIF2AK2 (por similaridade).
Metabolismo de carboidratos
- ALDOA
- B3GALT6 NM_080605
- B4GALT3 NM_003779 Homo sapiens UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,4-galactosiltransferase, polipeptídeo 3
- B4GALT5 NM_004776
- B4GALT7 NM_007255
- GSK3A
- GSK3B
- TPI1
- PGK1 Fosfoglicerato quinase
- PGAM5
- ENOPH1 Enolase fosfatase
- Lactato desidrogenase LDHA
- TALDO1 Transaldolase em shunt de pentose
- Metabolismo de manose TSTA3
Ciclo do ácido cítrico
- SDHA NM_004168 Succinato desidrogenase subunidade A
- SDHAF2 NM_017841
- SDHB NM_002973 Subunidade da proteína ferro-enxofre (IP) da succinato desidrogenase (SDH) que está envolvida no complexo II da cadeia de transporte de elétrons mitocondrial e é responsável pela transferência de elétrons do succinato para a ubiquinona (coenzima Q)
- SDHC NM_003000 Subunidade de ancoragem à membrana da succinato desidrogenase (SDH) que está envolvida no complexo II da cadeia de transporte de elétrons mitocondrial e é responsável pela transferência de elétrons do succinato para a ubiquinona (coenzima Q).
- SDHD NM_003001
Metabolismo lipídico
- HADHA Subunidade alfa trifuncional de proteína
Metabolismo de aminoácidos
- COMT Catecol-O-metil transferase)
NADH desidrogenase
- NDUFA2 NM_002488
- NDUFA3 NM_004542
- NDUFA4 NM_002489
- NDUFA5 NM_005000
- NDUFA6 NM_002490
- NDUFA7 NM_005001 Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) 1 subcomplexo alfa, 7, 14,5 kDa
- NDUFA8 NM_014222
- NDUFA9 NM_005002
- NDUFA10 NM_004544
- NDUFA11 NM_175614
- NDUFA12 NM_018838
- NDUFA13 NM_015965
- NDUFAF2 NM_174889
- NDUFAF3 NM_199069
- NDUFAF4 NM_014165
- NDUFB2 NM_004546
- NDUFB3 NM_002491
- NDUFB4 NM_004547
- NDUFB5 NM_002492
- NDUFB6 NM_002493
- NDUFB7 NM_004146 Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) 1 subcomplexo beta, 7, 18 kDa
- NDUFB10 NM_004548
- NDUFB11 NM_019056
- NDUFB8 NM_005004
- NDUFB9 NM_005005
- NDUFC1 NM_002494Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) 1, subcomplexo desconhecido, 1, 6kDa
- NDUFC2 NM_004549
- NDUFC2-KCTD14 NM_001203260
- NDUFS5
- NDUFV2
- NDUFS2 NM_004550
- NDUFS3 NM_004551
- NDUFS4 NM_002495
- NDUFS5 NM_004552 Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) proteína Fe-S 5, 15kDa
- NDUFS6 NM_004553
- NDUFS7 NM_024407
- NDUFS8 NM_002496
- NDUFV1 NM_007103 Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) flavoproteína 1, 51kDa (NDUFV1),
- NDUFV2 NM_021074 Homo sapiens NADH desidrogenase (ubiquinona) flavoproteína 2, 24kDa (NDUFV2),
Citocromo C oxidase
(Observe que COX1, COX2 e COX3 são codificados mitocondrialmente)
- COX4I1 001861
- COX5B NM_001862
- COX6B1 NM_001863
- COX6C NM_004374
- COX7A2 NM_001865 Homo sapiens citocromo c oxidase subunidade VIIa polipeptídeo 2 (fígado) (COX7A2),
- COX7A2L NM_004718
- COX7C NM_001867
- COX8
- COX8A NM_004074 Homo sapiens citocromo c oxidase subunidade VIII (COX8), gene nuclear que codifica
- COX11 NM_004375
- COX14 NM_032901
- COX15 NM_004376
- COX16 NM_016468
- COX19 NM_001031617
- COX20 NM_198076
- CYC1 Homo sapiens citocromo c-1 (CYC1)
- UQCC NM_018244 Necessário para a montagem do complexo ubiquinol-citocromo c redutase (complexo da cadeia respiratória mitocondrial III ou complexo do citocromo b-c1)
- UQCR10 NM_013387
- UQCR11 NM_006830 Homo sapiens ubiquinol-citocromo c redutase (6,4 kD) subunidade (UQCR), mRNA
- UQCRB NM_006294
- UQCRC1 NM_003365 Homo sapiens ubiquinol-citocromo c redutase core proteína I (UQCRC1), mRNA
- UQCRC2 NM_003366
- UQCRHL NM_001089591
- UQCRQ NM_014402 Homo sapiens proteína de ligação à ubiquinona de baixa massa molecular (9,5 kD) (QP-C), mRNA
ATPase
- ATP2C1 NM_014382
- ATP5A1 NM_004046 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F1 mitocondrial, alfa
- ATP5B NM_001686
- ATP5C1 NM_005174
- ATP5D NM_001687 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F1 mitocondrial, delta
- ATP5F1 NM_001688
- ATP5G2 NM_005176
- ATP5G3 NM_001689 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F0 mitocondrial, subunidade c
- ATP5H NM_006356 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F0 mitocondrial, subunidade d
- ATP5J NM_001685
- ATP5J2 NM_004889 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F0 mitocondrial, subunidade f,
- ATP5J2-PTCD1 NM_001198879
- ATP5L NM_006476
- ATP5O NM_001697 Homo sapiens ATP sintase, transporte de H +, complexo F1 mitocondrial, subunidade O
- ATP5S NM_015684
- ATP5SL NM_018035
- ATP6AP1 NM_001183 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, proteína 1 de interação lisossomal (ATP6IP1),
- ATP6V0A2 NM_012463
- ATP6V0B NM_004047 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, lisossomal 21kDa, V0 subunidade c (ATP6V0B),
- ATP6V0C NM_001694 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, lisossomal 16kDa, V0 subunidade c (ATP6V0C),
- ATP6V0D1 NM_004691
- ATP6V0E1 NM_003945
- ATP6V1C1 NM_001695
- ATP6V1D NM_015994
- ATP6V1E1 NM_001696 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, lisossomal 31kDa, subunidade V1 E isoforma 1
- ATP6V1F NM_004231 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, lisossomal 14kDa, subunidade V1 F (ATP6V1F),
- ATP6V1G1 NM_004888 Homo sapiens ATPase, transporte de H +, lisossomal 13kDa, subunidade V1 G isoforma 1
- ATP6V1H NM_015941
- ATPAF2 NM_145691
- ATPIF1 NM_016311
Lisossoma
Proteasome
- PSMA1 NM_002786
- PSMA2 NM_002787
- PSMA3 NM_002788
- PSMA4 NM_002789
- PSMA5 NM_002790
- PSMA6 NM_002791
- PSMA7 NM_002792 Subunidade do proteassoma (prosome, macropaina) do Homo sapiens, tipo alfa, 7 (PSMA7),
- PSMB1 NM_002793 Subunidade do proteassoma (prosome, macropaina) do Homo sapiens, tipo beta, 1 (PSMB1), mRNA
- PSMB2 NM_002794 Subunidade do proteassoma (prosome, macropaina) do Homo sapiens, tipo beta, 2 (PSMB2), mRNA
- PSMB3 NM_002795
- PSMB4 NM_002796 Subunidade do proteassoma (prosome, macropaina) do Homo sapiens, tipo beta, 4 (PSMB4), mRNA
- PSMB5 NM_002797
- PSMB6 NM_002798
- PSMB7 NM_002799 Subunidade do proteassoma (prosome, macropaina) do Homo sapiens, tipo beta, 7 (PSMB7), mRNA
- PSMC2 NM_002803
- PSMC3 NM_002804
- PSMC4 NM_006503
- PSMC5 NM_002805
- PSMC6 NM_002806
- PSMD1 NM_002807
- PSMD10 NM_002814
- PSMD11 NM_002815 Proteassoma de Homo sapiens (prosome, macropaina) subunidade 26S, não ATPase, 11
- PSMD12 NM_002816
- PSMD13 NM_002817
- PSMD14 NM_005805
- PSMD2 NM_002808
- PSMD3 NM_002809
- PSMD4 NM_002810
- PSMD5 NM_005047
- PSMD6 NM_014814
- PSMD7 NM_002811
- PSMD8 NM_002812 Proteassoma de Homo sapiens (prosome, macropaina) subunidade 26S, não ATPase, 8 (PSMD8),
- PSMD9 NM_002813
- PSME2 NM_002818 Homo sapiens proteassoma (prosome, macropaina) subunidade ativadora 2 (PA28 beta)
- PSME3 NM_005789
- PSMF1 NM_006814
- PSMG2 NM_020232
- PSMG3 NM_032302
- PSMG4 NM_001128591
- UBA1 NM_003334 Homo sapiens enzima ativadora de ubiquitina E1 (temperatura A1S9T e BN75
- UBA2 NM_005499
- UBA3 NM_003968
- UBA5 NM_024818
- UBA52 NM_003333
- UBAC2 NM_177967
- UBALD1 NM_145253
- UBAP1 NM_016525
- UBAP2L NM_014847
- UBB NM_018955 Homo sapiens ubiquitina B (UBB), mRNA
- UBC NM_021009 Homo sapiens ubiquitina C (UBC), mRNA
- UBE2A NM_003336
- UBE2B NM_003337
- UBE2D2 NM_003339 Homo sapiens enzima de conjugação de ubiquitina E2D 2 (homólogo UBC4 / 5, levedura)
- UBE2D3 NM_003340
- UBE2D4 NM_015983
- UBE2E1 NM_003341
- UBE2E2 NM_152653
- UBE2E3 NM_006357
- UBE2F NM_080678
- UBE2G2 NM_003343
- UBE2H NM_003344
- UBE2I NM_003345 Homo sapiens enzima de conjugação de ubiquitina E2I (homólogo UBC9, levedura) (UBE2I),
- UBE2J1 NM_016021
- UBE2J2 NM_058167
- UBE2K NM_005339
- UBE2L3 NM_003347
- UBE2M NM_003969 Homo sapiens enzima de conjugação de ubiquitina E2M (homólogo UBC12, levedura) (UBE2M),
- UBE2N NM_003348
- UBE2NL NM_001012989
- UBE2Q1 NM_017582
- UBE2R2 NM_017811
- UBE2V1 NM_021988
- UBE2V2 NM_003350
- UBE2W NM_018299
- UBE2Z NM_023079
- UBE3A NM_000462
- UBE3B NM_130466
- UBE3C NM_014671
- UBE4A NM_004788
- UBE4B NM_006048
- USP10 NM_005153
- USP14 NM_005151
- USP16 NM_006447
- USP19 NM_006677
- USP22 NM_015276
- USP25 NM_013396
- USP27X NM_001145073
- USP33 NM_015017
- USP38 NM_032557
- USP39 NM_006590
- USP4 NM_003363
- USP47 NM_017944
- USP5 NM_003481
- USP7 NM_003470
- USP8 NM_005154
- USP9X NM_001039590
Ribonuclease
- Inibidor da ribonuclease RNH
Tioredutase
Estrutural
Citoesquelético
Síntese de organelas
Uma forma especializada de sinalização celular
- BLOC1S1
- BLOC1S2 NM_173809
- BLOC1S3 NM_212550
- BLOC1S4 NM_018366
- BLOC1S6 NM_012388
- AP1G1 NM_001128
- AP1M1 NM_032493
- AP2A1 NM_014203
- AP2A2 NM_012305
- AP2M1
- AP2S1 NM_004069
- AP3B1 NM_003664
- AP3D1 NM_003938
- AP3M1 NM_012095
- AP3S1 NM_001284
- AP3S2 NM_005829
- AP4B1 NM_006594
- AP5M1 NM_018229
- ANXA6 anexina 6
- ANXA7 anexina 7
- Vesículas revestidas AP1B1
- CLTA clatrina A (vesículas)
- CLTB clatrina B (vesículas)
- CLTC
Mitocôndria
Superfície
Adesão celular
Canais e transportadores
- ABCB10 NM_012089
- ABCB7 NM_004299
- ABCD3 NM_002857
- ABCE1 NM_002939
- ABCF1 NM_001090
- ABCF2 NM_005692
- ABCF3 NM_018358
- CALM1 Calmodulina retém íons de cálcio
- MFSD11 NM_024311 semelhante a MSFD10 também conhecido como TETRAN ou proteína semelhante ao transportador de tetraciclina
- MFSD12 NM_174983
- MFSD3 NM_138431
- MFSD5 NM_032889
- SLC15A4 NM_145648
- SLC20A1 NM_005415
- Carreador de oxoglutarato / malato mitocondrial SLC25A11
- SLC25A26 NM_173471
- SLC25A28 NM_031212
- SLC25A3 NM_002635
- SLC25A32 NM_030780
- SLC25A38 NM_017875
- SLC25A39 NM_016016
- SLC25A44 NM_014655
- SLC25A46 NM_138773
- SLC25A5 NM_001152
- SLC27A4 NM_005094
- SLC30A1 NM_021194
- SLC30A5 NM_022902
- SLC30A9 NM_006345
- SLC35A2 NM_005660
- SLC35A4 NM_080670
- SLC35B1 NM_005827
- SLC35B2 NM_178148
- SLC35C2 NM_015945
- SLC35E1 NM_024881
- SLC35E3 NM_018656
- SLC35F5 NM_025181
- SLC38A2 NM_018976
- SLC39A1 NM_014437
- SLC39A3 NM_144564
- SLC39A7 NM_006979
- SLC41A3 NM_017836
- SLC46A3 NM_181785
- SLC48A1 NM_017842
Receptores
- ACVR1 NM_001105 semelhante à família de receptores ACVRL1 TGF Beta síndrome de Rendu-Osler-Weber
- ACVR1B NM_004302
- Receptor de IgE de baixa afinidade CD23 FCER2 (lectina)
HLA / imunoglobulina / reconhecimento de células
- BAT1 também conhecido como DDX39B, que está envolvido no splicing de RNA
- BSG Basigin Immunoglobulin Superfamily, extraceluar metaloproteinase
- Fator de inibição da migração de macrófagos MIF
- TAPBP
Quinases / sinalização
- ADRBK1 pode diminuir a resposta à epinefrina
- AGPAT1 acil 3 fosfoglicerol acil transferase
- ARF1
- ARF3
- ARF4
- ARF5
- Superfamília ARL2 RAS
- Fator de estimulação da colônia CSF1 não altamente expresso constitutivamente em 5-12
- CSK C-src tirosina quinase
- DCT dopachrome tautomerase
- EFNA3
- FKBP1A
- Inibidor de dissociação de GDI1 GDP (família Rab)
- GNAS1 ubiquamente expresso, mas diferentemente impresso
- GNAI2
- HAX1 associado a tirosina quinases
- ILK Integrina ligada quinase
- MAPKAPK2
- MAP2K2
- MAP3K11
- Proteína de transferência de fosfatidilinositol PITPNM
- RAC1 Ro GTPase envolvida com muitas vias de sinalização
- RAP1B GTPase envolvida com adesão celular
- Ligação GTP relacionada com RAGA Ras
- STK19
- STK24 Serina / Treonina Quinase
- STK25
- Proteína de ativação YWHAB Tirosina 3-monooxigenase / triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo beta
- Proteína de ativação YWHAH Tirosina 3-monooxigenase / triptofano 5-monooxigenase, polipeptídeo h
- YWHAQ Tirosina 3-monooxigenase / triptofano 5-monooxigenase proteína de ativação, polipeptídeo teta
- YWHAZ Tirosina 3-monooxigenase / triptofano 5-monooxigenase proteína de ativação, polipeptídeo zeta
Fatores de crescimento
- AIF1
- Fator de crescimento derivado de Hepatoma HDGF (transloca para o núcleo)
- HGS
- LTBP4
- VEGFB
- ZFP36L1
Fator de necrose tecidual
- CD40 anteriormente TNFRSF5
Caseína quinase
Diversos
- ALAS1 Ácido aminolevulínico sintase tipo 1 (o tipo 2 é eritróide e associado à porfiria)
- Fator de troca de nucleotídeo de guanina ARHGEF2 Rho
- ARMET Fator neurotrófico derivado de astrócito mesencefálico
- Potenciador AES do terminal amino de divisão
- BECN1 envolvido em autofagia e parceiros com PI3K
- BUD31, anteriormente transcrição Maternal G10
- Creatina quinase CKB (reservatório de ATP)
- Citidina desaminase questionável: não está presente em níveis muito altos
- CPNE1
- ENSA (gene)
- FTH1 cadeia pesada de ferritina
- Tráfego vesicular GDI2 rab / ras
- GUK1 Guanilato quinase transfere fosfato de ATP para GMP
- HPRT hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase
- IFITM1 induzida por interferon, proteína transmembrana
- JTB (gene) Ponto de interrupção de translocação de salto
- MMPL2
- NME2 (anteriormente NM23B) Nucleosídeo difosfato quinase
- NÃO NÃO
- P4HB
- PRDX1 peroxirredoxina (reduz os peróxidos)
- PTMA Prothymosin
- RPA2 liga o DNA durante a replicação para mantê-lo alinhado
- Conjugação de sulfato SULT1A3 (nota: SULT1C é citado na literatura anterior como sendo onipresente, mas este pode ser um exemplo de diferentes marcas sendo usadas para se referir a uma área comum de 2 genes intimamente relacionados. Se a marca for muito curta, então pode não ser específico o suficiente para realmente especificar um membro de uma família de genes de outra)
- SYNGR2 Synaptogyrin (pode participar na translocação da vesícula)
- Tetratricopeptídeo , tetratricopeptídeo rico em glutamina pequena TTC1
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Esperma / testículo
Embora esta página seja dedicada a genes que devem ser expressos de forma ubíqua, esta seção é para genes cujo nome atual reflete sua regulação positiva relativa nos testículos
Veja também
- Gene induzível
- Genevestigator
- Expressão do gene espaço-temporal
- Proteínas essenciais em complexos de proteínas
- Gene
- Genoma
- Genoma mínimo
Referências
links externos
-
Hounkpe B. "Lista atualizada de genes e transcritos de manutenção de humanos e camundongos. Banco de dados HRT Atlas" . Universidade Estadual de Campinas.
De Hounkpe BW, Chenou F; de Lima F; De Paula E Nucleic Acids Research, gkaa609, https://doi.org/10.1093/nar/gkaa609 (2020)
-
Eisenberg E. "Lista de genes humanos domésticos" . Universidade de Tel Aviv.
De Eisenberg E, Levanon EY; Trends in Genetics 19, 362-365 (2003)
-
Eisenberg E. "Lista de genes humanos de manutenção" . Universidade de Tel Aviv.
De Eisenberg E, Levanon EY; Trends in Genetics, 29 (2013)