Em 9 de fevereiro de 1822, Jean-Pierre Boyer anexou os espanhóis da colônia de Santo Domingo , que poucos meses antes havia proclamado sua independência da Espanha (30 de novembro de 1821) com o nome de The Republica del Haiti Español . Uma tentativa de declarar sua aliança à Grande Colômbia , a bandeira foi hasteada nas primeiras semanas de 1822, mas durou pouco quando, nove semanas depois, Boyer acabou com a república.
Foi desenvolvido a partir da bandeira haitiana e foi adicionada uma cruz branca no centro. Na versão anterior, 17 estrelas brancas colocadas verticalmente ao longo da talha, duas estrelas brancas colocadas acima e abaixo da cruz, respectivamente, e 9 estrelas brancas colocadas verticalmente ao longo da talha.
Em 1861, o general Pedro Santana pediu à rainha Isabel II da Espanha que retomasse o controle da República Dominicana, após um período de apenas 17 anos de independência. A Espanha, que não aceitara a perda de suas colônias americanas 30 anos antes, aceitou sua proposta e tornou o país uma colônia.
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