Indicador de tensão codificado geneticamente - Genetically encoded voltage indicator

O indicador de voltagem geneticamente codificado (ou GEVI ) é uma proteína que pode detectar o potencial de membrana em uma célula e relacionar a mudança na voltagem a uma forma de saída, geralmente nível fluorescente . É uma ferramenta de registro optogenética promissora que permite exportar sinais eletrofisiológicos de células em cultura, animais vivos e, finalmente, do cérebro humano. Exemplos de GEVIs notáveis ​​incluem ArcLight, ASAP1, ASAP3, Archons, SomArchon e Ace2N-mNeon.

História

Apesar de a ideia de medição óptica da atividade neuronal ter sido proposta no final dos anos 1960, o primeiro GEVI bem-sucedido, conveniente o suficiente para ser colocado em uso real, não foi desenvolvido até que as tecnologias de engenharia genética se tornassem maduras no final dos anos 1990. O primeiro GEVI, denominado FlaSh, foi construído pela fusão de uma proteína fluorescente verde modificada com um canal de K + sensível à voltagem ( Shaker ). Ao contrário das proteínas fluorescentes, a descoberta de novos GEVIs raramente foi inspirada pela natureza, pois é difícil encontrar um organismo que tenha naturalmente a capacidade de alterar sua fluorescência com base na voltagem. Portanto, os novos GEVIs são principalmente produtos da engenharia genética e de proteínas.

Dois métodos podem ser utilizados para encontrar novos GEVIs: design racional e evolução direcionada . O método anterior contribui para a maioria das novas variantes do GEVI, mas pesquisas recentes usando a evolução direcionada têm mostrado resultados promissores na otimização do GEVI.

Estrutura

GEVI pode ter muitos projetos de configuração para realizar a função de detecção de tensão. Uma característica essencial da estrutura GEVI é que ele deve se situar na membrana celular. Conceitualmente, a estrutura de um GEVI deve permitir a função de detectar a diferença de voltagem e reportá-la pela mudança na fluorescência. Normalmente, o domínio de detecção de voltagem (VSD) de um GEVI se estende pela membrana e está conectado à (s) proteína (s) fluorescente (s). No entanto, não é necessário que a detecção e o relatório aconteçam em estruturas diferentes, por exemplo, Arcontes.

Por estrutura, GEVIs podem ser classificados em quatro categorias com base nas descobertas atuais: (1) GEVIs contêm um par de proteína FRET fluorescente, por exemplo, VSFP1, (2) GEVIs de opsina única, por exemplo, Arch, (3) GEVIs de par Opsin-FP FRET, por exemplo, MacQ-mCitrine, (4) FP único com tipos especiais de domínios de detecção de tensão, por exemplo, ASAP1. A maioria dos GEVIs é baseada na fosfatase sensível à voltagem Ciona intestinalis (Ci-VSP ou Ci-VSD (domínio)), que foi descoberta em 2005 a partir do levantamento genômico do organismo. Alguns GEVIs podem ter componentes semelhantes, mas com posicionamentos diferentes deles. Por exemplo, ASAP1 e ArcLight usam um VSD e um FP, mas o FP de ASAP1 está do lado de fora da célula, enquanto o de ArcLight está do lado de dentro, e os dois FPs de VSFP-Butterfly são separados pelo VSD, enquanto os dois FPs de Mermaid são relativamente próximos um do outro.

Tabela de GEVIs e sua estrutura
GEVI Ano de detecção Comunicando Precursor
Clarão 1997 Shaker ( canal K + ) GFP -
VSFP1 2001 Rat Kv2.1 ( canal K + ) Par FRET : CFP e YFP -
SPARC 2002 Canal Rat Na + GFP -
VSFP2's 2007 Ci-VSD Par FRET : CFP (Cerulean) e YFP (Citrino) VSFP1
Flare 2007 Kv1.4 ( canal K + ) YFP Clarão
VSFP3.1 2008 Ci-VSD CFP VSFP2's
sereia 2008 Ci-VSD Par FRET : Marine GFP (mUKG) e OFP (mKOκ) VSFP2's
hVOS 2008 Dipicrilamina GFP -
VSFP deslocados para o vermelho 2009 Ci-VSD RFP / YFP (Citrine, mOrange2, TagRFP ou mKate2) VSFP3.1
ADEREÇOS 2011 Proteorodopsina de absorção de verde modificada (GPR) Igual à esquerda -
Zahra, Zahra 2 2012 Nv-VSD, Dr-VSD Par FRET : CFP (Cerulean) e YFP (Citrino) VSFP2's
ArcLight 2012 Ci-VSD PHluorina super eclíptica modificada -
Arco 2012 Arquerodopsina 3 Igual à esquerda -
ElectricPk 2012 Ci-VSD EGFP circularmente permutado VSFP3.1
VSFP-Butterfly 2012 Ci-VSD Par FRET : YFP (mCitrine) e RFP (mKate2) VSFP2's
VSFP-CR 2013 Ci-VSD Par FRET : GFP (Clover) e RFP (mRuby2) VSFP2.3
Sereia 2 2013 Ci-VSD Par FRET : CFP (seCFP2) e YFP sereia
Mac GEVIs 2014 Rodopsina Mac (aceitador FRET) Doador FRET: mCitrine ou mOrange2 -
QuasAr1, QuasAr2 2014 Archaerhodopsina 3 modificada Igual à esquerda Arco
Arqueiro 2014 Archaerhodopsina 3 modificada Igual à esquerda Arco
ASAP1 2014 Gg-VSD modificado GFP permutado circularmente -
Ace GEVIs 2015 Rodopsina Ace modificada Doador FRET: mNeonGreen Mac GEVIs
ArcLightning 2015 Ci-VSD PHluorina super eclíptica modificada ArcLight
Pado 2016 Canal de prótons controlado por voltagem PHluorina super eclíptica -
ASAP2f 2016 Gg-VSD modificado GFP permutado circularmente ASAP1
FlicR1 2016 Ci-VSD RFP permutado circularmente (mApple) VSFP3.1
Bongwoori 2017 Ci-VSD PHluorina super eclíptica modificada ArcLight
ASAP2s 2017 Gg-VSD modificado GFP permutado circularmente ASAP1
ASAP-Y 2017 Gg-VSD modificado GFP permutado circularmente ASAP1
(pa) QuasAr3 (-s) 2019 Archaerhodopsina 3 modificada Igual à esquerda QuasAr2
Voltron (-ST) 2019 Rodopsina Ace modificada (Ace2) Doador FRET: Janelia Fluor (químico) -
ASAP3 2019 Gg-VSD modificado GFP permutado circularmente ASAP2s
  1. ↑ Os nomes em itálico indicam GEVIs não nomeados.

Características

Um GEVI pode ser avaliado por suas muitas características. Essas características podem ser classificadas em duas categorias: desempenho e compatibilidade. As propriedades de desempenho incluem brilho, fotoestabilidade , sensibilidade, cinética (velocidade), linearidade de resposta, etc., enquanto as propriedades de compatibilidade cobrem toxicidade ( fototoxicidade ), localização da membrana plasmática, adaptabilidade de imagem de tecido profundo, etc. Por enquanto, não existe O GEVI atende a todas as propriedades desejadas, portanto, buscar um GEVI perfeito ainda é uma área de pesquisa bastante competitiva.

Aplicações e vantagens

Diferentes tipos de GEVIs estão sendo desenvolvidos em muitas áreas de pesquisa biológica ou fisiológica. É considerado superior aos métodos convencionais de detecção de voltagem, como registros eletrofisiológicos baseados em eletrodos , imagens de cálcio ou corantes sensíveis à voltagem . Tem resolução espacial subcelular e resolução temporal tão baixa quanto 0,2 milissegundos, cerca de uma ordem de magnitude mais rápida do que a imagem de cálcio. Isso permite fidelidade de detecção de pico comparável à eletrofisiologia baseada em eletrodo, mas sem a capacidade de invasão. Os pesquisadores o usaram para sondar as comunicações neurais de um cérebro intacto (de Drosophila ou camundongo), spikes elétricos de bactérias ( E. coli ) e cardiomiócitos derivados de células-tronco humanas .

Referências