Indicador de tensão codificado geneticamente - Genetically encoded voltage indicator
O indicador de voltagem geneticamente codificado (ou GEVI ) é uma proteína que pode detectar o potencial de membrana em uma célula e relacionar a mudança na voltagem a uma forma de saída, geralmente nível fluorescente . É uma ferramenta de registro optogenética promissora que permite exportar sinais eletrofisiológicos de células em cultura, animais vivos e, finalmente, do cérebro humano. Exemplos de GEVIs notáveis incluem ArcLight, ASAP1, ASAP3, Archons, SomArchon e Ace2N-mNeon.
História
Apesar de a ideia de medição óptica da atividade neuronal ter sido proposta no final dos anos 1960, o primeiro GEVI bem-sucedido, conveniente o suficiente para ser colocado em uso real, não foi desenvolvido até que as tecnologias de engenharia genética se tornassem maduras no final dos anos 1990. O primeiro GEVI, denominado FlaSh, foi construído pela fusão de uma proteína fluorescente verde modificada com um canal de K + sensível à voltagem ( Shaker ). Ao contrário das proteínas fluorescentes, a descoberta de novos GEVIs raramente foi inspirada pela natureza, pois é difícil encontrar um organismo que tenha naturalmente a capacidade de alterar sua fluorescência com base na voltagem. Portanto, os novos GEVIs são principalmente produtos da engenharia genética e de proteínas.
Dois métodos podem ser utilizados para encontrar novos GEVIs: design racional e evolução direcionada . O método anterior contribui para a maioria das novas variantes do GEVI, mas pesquisas recentes usando a evolução direcionada têm mostrado resultados promissores na otimização do GEVI.
Estrutura
GEVI pode ter muitos projetos de configuração para realizar a função de detecção de tensão. Uma característica essencial da estrutura GEVI é que ele deve se situar na membrana celular. Conceitualmente, a estrutura de um GEVI deve permitir a função de detectar a diferença de voltagem e reportá-la pela mudança na fluorescência. Normalmente, o domínio de detecção de voltagem (VSD) de um GEVI se estende pela membrana e está conectado à (s) proteína (s) fluorescente (s). No entanto, não é necessário que a detecção e o relatório aconteçam em estruturas diferentes, por exemplo, Arcontes.
Por estrutura, GEVIs podem ser classificados em quatro categorias com base nas descobertas atuais: (1) GEVIs contêm um par de proteína FRET fluorescente, por exemplo, VSFP1, (2) GEVIs de opsina única, por exemplo, Arch, (3) GEVIs de par Opsin-FP FRET, por exemplo, MacQ-mCitrine, (4) FP único com tipos especiais de domínios de detecção de tensão, por exemplo, ASAP1. A maioria dos GEVIs é baseada na fosfatase sensível à voltagem Ciona intestinalis (Ci-VSP ou Ci-VSD (domínio)), que foi descoberta em 2005 a partir do levantamento genômico do organismo. Alguns GEVIs podem ter componentes semelhantes, mas com posicionamentos diferentes deles. Por exemplo, ASAP1 e ArcLight usam um VSD e um FP, mas o FP de ASAP1 está do lado de fora da célula, enquanto o de ArcLight está do lado de dentro, e os dois FPs de VSFP-Butterfly são separados pelo VSD, enquanto os dois FPs de Mermaid são relativamente próximos um do outro.
GEVI | Ano | de detecção | Comunicando | Precursor |
---|---|---|---|---|
Clarão | 1997 | Shaker ( canal K + ) | GFP | - |
VSFP1 | 2001 | Rat Kv2.1 ( canal K + ) | Par FRET : CFP e YFP | - |
SPARC | 2002 | Canal Rat Na + | GFP | - |
VSFP2's | 2007 | Ci-VSD | Par FRET : CFP (Cerulean) e YFP (Citrino) | VSFP1 |
Flare | 2007 | Kv1.4 ( canal K + ) | YFP | Clarão |
VSFP3.1 | 2008 | Ci-VSD | CFP | VSFP2's |
sereia | 2008 | Ci-VSD | Par FRET : Marine GFP (mUKG) e OFP (mKOκ) | VSFP2's |
hVOS | 2008 | Dipicrilamina | GFP | - |
VSFP deslocados para o vermelho | 2009 | Ci-VSD | RFP / YFP (Citrine, mOrange2, TagRFP ou mKate2) | VSFP3.1 |
ADEREÇOS | 2011 | Proteorodopsina de absorção de verde modificada (GPR) | Igual à esquerda | - |
Zahra, Zahra 2 | 2012 | Nv-VSD, Dr-VSD | Par FRET : CFP (Cerulean) e YFP (Citrino) | VSFP2's |
ArcLight | 2012 | Ci-VSD | PHluorina super eclíptica modificada | - |
Arco | 2012 | Arquerodopsina 3 | Igual à esquerda | - |
ElectricPk | 2012 | Ci-VSD | EGFP circularmente permutado | VSFP3.1 |
VSFP-Butterfly | 2012 | Ci-VSD | Par FRET : YFP (mCitrine) e RFP (mKate2) | VSFP2's |
VSFP-CR | 2013 | Ci-VSD | Par FRET : GFP (Clover) e RFP (mRuby2) | VSFP2.3 |
Sereia 2 | 2013 | Ci-VSD | Par FRET : CFP (seCFP2) e YFP | sereia |
Mac GEVIs | 2014 | Rodopsina Mac (aceitador FRET) | Doador FRET: mCitrine ou mOrange2 | - |
QuasAr1, QuasAr2 | 2014 | Archaerhodopsina 3 modificada | Igual à esquerda | Arco |
Arqueiro | 2014 | Archaerhodopsina 3 modificada | Igual à esquerda | Arco |
ASAP1 | 2014 | Gg-VSD modificado | GFP permutado circularmente | - |
Ace GEVIs | 2015 | Rodopsina Ace modificada | Doador FRET: mNeonGreen | Mac GEVIs |
ArcLightning | 2015 | Ci-VSD | PHluorina super eclíptica modificada | ArcLight |
Pado | 2016 | Canal de prótons controlado por voltagem | PHluorina super eclíptica | - |
ASAP2f | 2016 | Gg-VSD modificado | GFP permutado circularmente | ASAP1 |
FlicR1 | 2016 | Ci-VSD | RFP permutado circularmente (mApple) | VSFP3.1 |
Bongwoori | 2017 | Ci-VSD | PHluorina super eclíptica modificada | ArcLight |
ASAP2s | 2017 | Gg-VSD modificado | GFP permutado circularmente | ASAP1 |
ASAP-Y | 2017 | Gg-VSD modificado | GFP permutado circularmente | ASAP1 |
(pa) QuasAr3 (-s) | 2019 | Archaerhodopsina 3 modificada | Igual à esquerda | QuasAr2 |
Voltron (-ST) | 2019 | Rodopsina Ace modificada (Ace2) | Doador FRET: Janelia Fluor (químico) | - |
ASAP3 | 2019 | Gg-VSD modificado | GFP permutado circularmente | ASAP2s |
- ↑ Os nomes em itálico indicam GEVIs não nomeados.
Características
Um GEVI pode ser avaliado por suas muitas características. Essas características podem ser classificadas em duas categorias: desempenho e compatibilidade. As propriedades de desempenho incluem brilho, fotoestabilidade , sensibilidade, cinética (velocidade), linearidade de resposta, etc., enquanto as propriedades de compatibilidade cobrem toxicidade ( fototoxicidade ), localização da membrana plasmática, adaptabilidade de imagem de tecido profundo, etc. Por enquanto, não existe O GEVI atende a todas as propriedades desejadas, portanto, buscar um GEVI perfeito ainda é uma área de pesquisa bastante competitiva.
Aplicações e vantagens
Diferentes tipos de GEVIs estão sendo desenvolvidos em muitas áreas de pesquisa biológica ou fisiológica. É considerado superior aos métodos convencionais de detecção de voltagem, como registros eletrofisiológicos baseados em eletrodos , imagens de cálcio ou corantes sensíveis à voltagem . Tem resolução espacial subcelular e resolução temporal tão baixa quanto 0,2 milissegundos, cerca de uma ordem de magnitude mais rápida do que a imagem de cálcio. Isso permite fidelidade de detecção de pico comparável à eletrofisiologia baseada em eletrodo, mas sem a capacidade de invasão. Os pesquisadores o usaram para sondar as comunicações neurais de um cérebro intacto (de Drosophila ou camundongo), spikes elétricos de bactérias ( E. coli ) e cardiomiócitos derivados de células-tronco humanas .