Aspartoacilase - Aspartoacylase

UM SPA
Estruturas disponíveis
PDB Pesquisa Ortholog: PDBe RCSB
Identificadores
Apelido ASPA , ACY2, ASP, aspartoacilase
IDs externos OMIM : 608034 MGI : 87914 HomoloGene : 33 GeneCards : ASPA
Ortólogos
Espécies Humano Mouse
Entrez
Conjunto
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_000049
NM_001128085

NM_023113

RefSeq (proteína)

NP_000040
NP_001121557

NP_075602

Localização (UCSC) Chr 17: 3,47 - 3,5 Mb Chr 11: 73,3 - 73,33 Mb
Pesquisa PubMed
Wikidata
Ver / Editar Humano Ver / Editar Mouse
Aspartoacilase
ASPA dimer.png
Estrutura do dímero de aspartoacilase. Gerado a partir de 2I3C.
Identificadores
EC nº 3.5.1.15
Bancos de dados
IntEnz Vista IntEnz
BRENDA Entrada BRENDA
ExPASy NiceZyme view
KEGG Entrada KEGG
MetaCyc via metabólica
PRIAM perfil
Estruturas PDB RCSB PDB PDBe PDBsum

A aspartoacilase é uma enzima hidrolase ( EC 3.5.1.15 , aminoacilase II , N-acetilaspartato amidohidrolase , acetil-aspártico desaminase , acilase II , ASPA ) que em humanos é codificada pelo gene ASPA . O ASPA é responsável por catalisar a desacilação do N -acetil-l-aspartato ( N-acetilaspartato) em aspartato e acetato . É uma hidrolase dependente de zinco que promove a desprotonação da água para uso como nucleófilo em um mecanismo análogo a muitas outras hidrolases dependentes de zinco. É mais comumente encontrado no cérebro , onde controla os níveis de N-actetil-l-aspartato. As mutações que resultam na perda da atividade da aspartoacilase estão associadas à doença de Canavan , uma doença neurodegenerativa autossômica recessiva rara .

Estrutura

A aspartoacilase é um dímero de dois monômeros idênticos de 313 aminoácidos e usa um cofator de zinco em cada um. Existem dois domínios distintos em cada monômero: o domínio N-terminal dos resíduos 1-212 e o domínio C-terminal dos resíduos 213-313. O domínio N-terminal da aspartoacilase é semelhante ao das hidrolases dependentes de zinco, como a carboxipeptidaseA . No entanto, as carboxipeptidases não têm algo semelhante ao domínio C. Na carboxipeptidase A, o sítio ativo é acessível a grandes substratos, como o resíduo C-terminal volumoso dos polipeptídeos , enquanto o domínio C estereoquimicamente impede o acesso ao sítio ativo na aspartoacilase. Em vez disso, o domínio N e o domínio C da aspartoacilase formam um canal estreito e profundo que leva ao sítio ativo.

O cofator de zinco é encontrado no sítio ativo e é mantido por Glu-24, His-21 e His 116. O substrato é mantido no lugar por Arg-63, Asn-70, Arg-71, Tyr-164, Arg- 168 e Tyr-288. O cofator de zinco é usado para diminuir o pKa de uma água ligada de modo que um ataque ao N-acetil-L-aspartato possa ocorrer e para estabilizar o intermediário tetraédrico resultante junto com Arg-63 e Glu-178.

Monômero da aspartoacilase com o domínio N em verde, o domínio C em amarelo e o cofator de zinco em vermelho. Gerado a partir de 2I3C.
Sítio ativo da aspartoacilase com um N-fosfonamidato-L-aspartato ligado. Este é um análogo intermediário tetraédrico com fósforo substituindo o carbono atacado. Na estrutura, zinco, Arg-63 e Glu-178 estão estabilizando o intermediário tetraédrico. Gerado a partir de 2O4H.

Mecanismo

Existem dois tipos de mecanismos possíveis para hidrolases dependentes de zinco, dependendo de qual é o nucleófilo . O primeiro usa água desprotonada e o segundo ataca com um aspartato ou glutamato formando primeiro um anidrido . A aspartoacilase segue o mecanismo da água desprotonada. O zinco reduz o pKa de uma molécula de água ligada e a reação prossegue por meio de um ataque ao N-acetil-l-aspartato quando a molécula de água é desprotonada por Glu-178. Isso leva a um intermediário tetraédrico que é estabilizado pelo zinco, Arg-63 e Glu-178. Finalmente, o carbonil é então reformado, a ligação com o nitrogênio é quebrada e o nitrogênio é protonado pelo próton tomado pelo Glu-178, tudo em uma etapa combinada.

Mecanismo da aspartoacilase. Todos os resíduos de coordenação não são mostrados para maior clareza.

Função biológica

A aspartoacilase é usada para metabolizar o N-acetil-L-aspartato catalisando sua desacilação. A aspartoacilase impede o acúmulo de N-acetil-L-aspartato no cérebro. Acredita-se que o controle dos níveis de N-acetil-L-aspartato seja essencial para o desenvolvimento e manutenção da substância branca . Não se sabe por que tanto N-acetil-L-aspartato é produzido no cérebro nem qual é sua função primária. No entanto, uma hipótese é que é potencialmente usado como um reservatório químico que pode ser aproveitado para o acetato para a síntese de acetil-CoA ou aspartato para a síntese de glutamato . Dessa forma, o N-acetil-L-aspartato pode ser usado para transportar essas moléculas precursoras e a aspartoacilase é usada para liberá-las. Por exemplo, o N-acetil-L-aspartato produzido em neurônios pode ser transportado para os oligodendrócitos e o acetato liberado pode ser usado para a síntese de mielina . Outra hipótese é que o N-acetil-L-aspartato é um osmólito essencial que atua como uma bomba de água molecular que ajuda a manter um equilíbrio adequado de fluidos no cérebro.

Relevância da doença

Mutações que levam à perda da atividade da aspartoacilase foram identificadas como a causa da doença de Canavan . A doença de Canavan é uma doença autossômica recessiva rara que causa degeneração esponjosa da substância branca no cérebro e retardo psicomotor grave, geralmente levando à morte em uma idade jovem. A perda da atividade da aspartoacilase leva ao acúmulo de N-acetil-L-aspartato no cérebro e a um aumento da concentração na urina em até 60 vezes os níveis normais. Embora o mecanismo exato de como a perda da atividade da aspartoacilase leva à doença de Canavan não seja totalmente compreendido, existem duas explicações primárias concorrentes. A primeira é que leva à síntese de mielina defeituosa devido a uma deficiência de acetil-CoA derivada do produto acetato. Outra explicação é que os níveis elevados de N-acetil-l-aspartato interferem no mecanismo osmorregulador normal do cérebro , levando ao desequilíbrio osmótico.

Há mais de 70 mutações relatadas dessa enzima, mas as mais comuns são as substituições de aminoácidos E285A e A305E. E285A reduz a atividade da aspartoacilase até 0,3% de sua função normal e é encontrado em 98% dos casos com ascendência judaica Ashkenazi . A mutação A305E é encontrada em cerca de 40% dos pacientes não judeus e reduz a atividade para cerca de 10%. Destas duas mutações, uma estrutura cristalina do mutante E285A foi tomada, mostrando que a perda da ligação de hidrogênio do glutamato leva a uma mudança conformacional que distorce o sítio ativo e altera a ligação do substrato, levando a uma atividade catalítica muito menor.

Distorção do sítio ativo causada pela mutação E285A. ASPA de tipo selvagem está à esquerda (2O4H) e E285A à direita (4NFR).

Referências

links externos