Lista de modelos de simulação COVID-19 - List of COVID-19 simulation models
Os modelos de simulação do COVID-19 são modelos matemáticos de doenças infecciosas para a disseminação do COVID-19 . A lista não deve ser confundida com os aplicativos COVID-19 usados principalmente para rastreamento de contato digital .
Observe que alguns dos aplicativos listados são modelos ou simuladores apenas para sites , e alguns deles dependem (ou usam) dados em tempo real de outras fontes.
Modelos com o respaldo mais científico
A sublista contém simuladores baseados em modelos teóricos. Devido ao alto número de pesquisas pré-impressão criadas e impulsionadas pela pandemia COVID-19, especialmente os modelos mais novos devem ser considerados apenas com maior rigor científico .
Simulações e modelos
- Chen et al. simulação baseada no modelo Bats-Hosts-Reservoir-People (BHRP) (simplificado apenas para RP)
- CoSim19 - Prof Lehr, baseado no modelo SEIRD
- MODELAGEM DE MOBILIDADE COVID-19 - Stanford com base no modelo SEIR
- Simulador COVID-19 - Harvard Medical School baseado em um modelo validado de dinâmica de sistema (compartimento)
- COVID-19 Surge - CDC
- COVIDSIM - por Mark Kok Yew Ng et al.
- CovidSim - Imperial College London , Centro MRC para Análise Global de Doenças Infecciosas , Neil Ferguson et al.
- CovidSim - Projeto de pesquisa da Universidade de Ciências Aplicadas de Munique, Prof Köster
- COVIDSim - escrito em MATLAB por Ng e Gui
- CovidSIM.eu - Martin Eichner, Markus Schwehm apoiado pela Universidade de Tübingen e patrocinado pelo Ministério Federal Alemão de Educação e Pesquisa .
- CovidSIM - Schneider et al.
- CovRadar - para vigilância molecular da proteína pico Corona
- Modelo do Dr. Ghaffarzadegan
- Event Horizon - COVID-19 - HU Berlin baseado no modelo SIR-X
- IA evolutiva - "Intervenções não farmacêuticas (INP) que a IA gera para diferentes países e regiões ao longo do tempo, seu efeito previsto."
- Modelo IHME - Instituto de Métricas e Avaliação de Saúde modelo COVID
- OxCGRT - The Oxford COVID-19 Government Response Tracker
- SC-COSMO - Modelo de Simulação Stanford-CIDE Coronavirus
- SECIR - Modelo por Helmholtz Center for Infection Research
- Investimento inteligente de recursos de teste de RNA de vírus para aprimorar a mitigação da Covid-19
- Coleção de Epidemiologia do SIAM
- Modelo Youyang Gu COVID
Bancos de dados genômicos
Vários desses modelos fazem uso de bancos de dados de genoma, incluindo o seguinte:
- Banco de dados de DNA do Japão
- Arquivo Europeu de Nucleotídeos
- GISAID
- Atribuição filogenética de linhagens de surto globais nomeadas
Consórcios, grupos de pesquisa, outras coleções
- Lista do CDC de Inclusão de Previsões e Suposições - lista grande com diferentes modelos, etc.
- CORSMA - Consórcio da UE (COVID-19-Outbreak Response combinando E-health, Serolomics, Modeling, Artificial Intelligence and Implementation Research)
- COVID-19 Forecast Hub - Serve como um repositório central de previsões e previsões de mais de 50 grupos de pesquisa internacionais.
-
Nextstrain - projeto de código aberto para aproveitar o potencial científico e de saúde pública dos dados do genoma do patógeno
- Veja também os recursos Nextstrain SARS-CoV-2
- SIMID - Modelos de Simulação de Doenças Infecciosas - Consórcio de Pesquisa da Bélgica
- RAMP - Assistência Rápida na Modelagem da Pandemia (Reino Unido)
- UT Austin COVID-19 Modeling Consortium
- Abordagens computacionais para promover a inovação no tratamento e diagnóstico de doenças infecciosas por fronteiras
Monitores, modelos ou painéis de vacinação
Nota: Os seguintes recursos (adicionais) são baseados principalmente em dados reais, não em simulação. Eles podem incluir recursos preditivos, por exemplo, estimativa da taxa de vacinação, mas em geral não são baseados em fundamentos teóricos ou de modelagem como a lista principal deste artigo. No entanto, a previsão continua importante. (Veja por exemplo: O Centro de Previsão COVID-19 )
- Painel COVID-19 - Centro de Ciência e Engenharia de Sistemas (CSSE) da Universidade Johns Hopkins (JHU)
- COVIDVaxView pelo CDC
- Conjunto de dados Datahub Novel Coronavirus 2019 - conjunto de dados COVID-19 Série temporal da doença de Coronavirus 2019 (COVID-19) listando casos confirmados, mortes relatadas e recuperações relatadas.
- Impfdashboard.de - monitor de vacinação da Alemanha
- Simulation der COVID19-Impfkampagne - Monitor para campanha de vacinação na Alemanha por Zi Data Science Lab
-
O Instituto de Métricas e Avaliação de Saúde (IHME) Projeções COVID-19
- Consulte também o modelo COVID do Institute for Health Metrics and Evaluation
Modelos com menos respaldo científico
Os modelos a seguir são apenas para fins educacionais.
- Modelo de autômatos de defesa celular
- Simulador Covid-19
- COVID19: 7 principais - uma lista com curadoria publicada no Medium
- github.com/topics: covid-19
- Simulador ISEE Systems COVID-19
- nCoV2019.live - "Números de que você precisa em um piscar de olhos" por Schiffmann / Conlon
- cov19.cc- por Conlon
- Simul8 - Recursos de simulação COVID-19
- Simulando coronavírus com o modelo SIR
- Simulação de propagação de vírus
- ( American Chemical Society ) CAS COVID-19 BIOINDICATOR EXPLORER
- Rastreador de dados COVID do CDC
- Parceiros da Sociedade Civil em Solidariedade contra COVID-19 (CSPAC): Completo, ao vivo, global, Relatório de Status COVID-19 para 251 localidades e 71 navios
- Instituto Cornell de Pesquisa Social e Econômica (CISER): Fontes de dados COVID-19
- Modelagem multifásica Euleriana-Lagrangiana , por exemplo, para transmissão de COVID-19 em elevadores com base em CFD
- Onset of Symptoms of COVID-19 simulação (Stochastic Progression Model) por Larsen et al.
- Nosso mundo em dados de dados de origem do Coronavirus
- The Atlantic 's COVID 19 Acompanhamento do Projeto
- Vadere - framework de código aberto para simulação de pedestres e multidões
- Painel do Coronavírus da OMS (COVID-19)
Treinamentos e outros recursos
- Especialização em modelagem de doenças infecciosas - fornecida no Coursera pelo Imperial College London
- Apresentando o Simulador COVID-19 e o Kit de Ferramentas de Aprendizado de Máquina para Predição de Spread COVID-19 - Blog do AWS Machine Learning
Veja também
- Modelo SIR
- Simulação de computador
- Modelagem matemática de doenças infecciosas
- Biologia Computacional
- Bioinformática
Referências
Leitura adicional
- Adam D (abril de 2020). "Relatório especial: as simulações que impulsionam a resposta do mundo ao COVID-19". Nature . 580 (7803): 316–318. doi : 10.1038 / d41586-020-01003-6 . PMID 32242115 . S2CID 214771531 .
- Alper J. "Guia de aprendizagem de modelagem de covid WXML 2020" . Departamento de Matemática . Seattle, Washington: University of Washington.
- Fuller J (março de 2021). "Quais são os modelos de modelagem COVID-19 (filosoficamente falando)?" . História e Filosofia das Ciências da Vida . 43 (2): 47. doi : 10,1007 / s40656-021-00407-5 . PMC 7994354 . PMID 33770267 .
- Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (julho de 2021). Prabha S, Karthikeyan P, Kamalanand K, Selvaganesan N (eds.). Modelagem Computacional e Imagem para SARS-CoV-2 e COVID-19 (1 ed.). Boca Raton: CRC Press. doi : 10.1201 / 9781003142584 . ISBN 978-1-003-14258-4.
- Roberts M, Driggs D, Selby I, Sala E, Schönlieb CB (1 de junho de 2021). "Fighting a Pandemic with Medical Imaging and Machine Learning: Lessons Learn from COVID-19" . SIAM News .