Integron - Integron

Os integrons são mecanismos genéticos que permitem que as bactérias se adaptem e evoluam rapidamente por meio do armazenamento e da expressão de novos genes. Esses genes são incorporados em uma estrutura genética específica chamada cassete de gene (um termo que está mudando recentemente para cassete de integron) que geralmente carrega uma estrutura de leitura aberta sem promotor (ORF) junto com um local de recombinação ( attC ). Os cassetes de integron são incorporados ao sítio attI da plataforma integron por reações de recombinação sítio-específicas mediadas pela integrase.

Descoberta

Os integrons foram inicialmente descobertos em plasmídeos conjugativos por meio de seu papel na resistência aos antibióticos. Na verdade, esses integrons móveis, como são agora conhecidos, podem carregar uma variedade de cassetes contendo genes que estão quase exclusivamente relacionados à resistência aos antibióticos. Estudos posteriores chegaram à conclusão de que os integrons são elementos cromossômicos e que sua mobilização em plasmídeos foi promovida por transposons e selecionada pelo uso intensivo de antibióticos. A função da maioria dos cassetes encontrados em integrons cromossômicos permanece desconhecida.

Estrutura

Um integron é minimamente composto por:

  • um gene que codifica para uma recombinase específica do local : intI, pertencente à família da integrase
  • um local de recombinação proximal : attI , que é reconhecido pela integrase e no qual os cassetes de genes podem ser inseridos
  • um promotor: Pc , que dirige a transcrição de genes codificados por cassete

Cassetes de genes

Além disso, um integron geralmente contém um ou mais cassetes de genes que foram incorporados a ele. Os cassetes de genes podem codificar genes para resistência a antibióticos , embora a maioria dos genes em integrons não sejam caracterizados. Uma sequência attC (também chamada de 59-be) é uma repetição que flanqueia os cassetes e permite que os cassetes sejam integrados no local attI , excisados ​​e submetidos à transferência horizontal de genes .

Ocorrência

Os integrons podem ser encontrados como parte de elementos genéticos móveis , como plasmídeos e transposons . Os integrons também podem ser encontrados nos cromossomos .

Terminologia

O termo superintegron foi aplicado pela primeira vez em 1998 (mas sem definição) para o integron com uma longa matriz de cassetes no pequeno cromossomo de Vibrio cholerae . O termo tem sido usado para integrons de vários comprimentos de matrizes de cassetes ou para integrons em cromossomos bacterianos (versus, por exemplo, plasmídeos). O significado de "superintegron" não estava claro e uma nova terminologia, "integron cromossômico sedendário", que é melhor definida (quando sua frequência no pan-genoma de uma determinada espécie era de 100%, ou quando continham mais de 19 sítios attC) agora é preferencialmente usado.

Referências

Leitura adicional

links externos

  • IntegronFinder - Uma ferramenta para detectar integrons em genomas bacterianos
  • INTEGRALL - O banco de dados Integron