Subtipos de HIV - Subtypes of HIV

Vírus da imunodeficiência humana
Árvore filogenética dos vírus SIV e HIV
Árvore filogenética dos vírus SIV e HIV
Classificação científicaEdite esta classificação
(não classificado): Vírus
Reino : Riboviria
Reino: Pararnavirae
Filo: Artverviricota
Classe: Revtraviricetes
Pedido: Ortervirales
Família: Retroviridae
Subfamília: Orthoretrovirinae
Gênero: Lentivirus
Grupos incluídos
Táxons cladisticamente incluídos, mas tradicionalmente excluídos

Um dos obstáculos ao tratamento do vírus da imunodeficiência humana (HIV) é sua alta variabilidade genética. O HIV pode ser dividido em dois tipos principais, HIV tipo 1 (HIV-1) e HIV tipo 2 (HIV-2). O HIV-1 está relacionado a vírus encontrados em chimpanzés e gorilas que vivem na África Ocidental, enquanto o vírus HIV-2 está relacionado a vírus encontrados no fuliginoso mangabey , um vulnerável primata da África Ocidental. Os vírus HIV-1 podem ser divididos em grupos. Os vírus HIV-1 do grupo M predominam e são responsáveis ​​pela pandemia da AIDS. O grupo M pode ser subdividido em subtipos com base nos dados da sequência genética. Alguns dos subtipos são conhecidos por serem mais virulentos ou resistentes a diferentes medicamentos. Da mesma forma, os vírus HIV-2 são considerados menos virulentos e transmissíveis do que os vírus do grupo HIV-1 M, embora o HIV-2 também seja conhecido por causar AIDS.

Tipos principais

HIV-1

O HIV-1 é a cepa mais comum e patogênica do vírus. Mais de 2 milhões dessas infecções ocorrem anualmente. Os cientistas dividem o HIV-1 em um grupo principal (Grupo M) e dois ou mais grupos menores, ou seja, Grupo N, O e possivelmente um grupo P. Acredita-se que cada grupo representa uma transmissão independente do SIV para os humanos (mas subtipos dentro de um grupo não são). Um total de 39 ORFs são encontrados em todos os seis possíveis quadros de leitura (RFs) da sequência completa do genoma do HIV-1, mas apenas alguns deles são funcionais.

Grupo M

Com 'M' para "maior", este é de longe o tipo mais comum de HIV, com mais de 90% dos casos de HIV / AIDS derivados da infecção pelo HIV-1 do grupo M. Este vírus principal do HIV que foi a fonte de pré -1960 vírus pandêmicos originados na década de 1920 em Léopoldville , no Congo Belga , hoje conhecido como Kinshasa, que agora é a capital da República Democrática do Congo (RDC). Sua origem zoonótica é o SIVcpz, que infecta chimpanzés. O grupo M é subdividido em clados, chamados subtipos, que também recebem uma letra. Existem também "formas recombinantes circulantes" ou CRFs derivados da recombinação entre vírus de subtipos diferentes, aos quais é dado um número a cada um. CRF12_BF, por exemplo, é uma recombinação entre os subtipos B e F.

  • O subtipo A é comum na África oriental.
  • O subtipo B é a forma dominante na Europa, nas Américas, no Japão e na Austrália. Além disso, o subtipo B é a forma mais comum no Oriente Médio e no Norte da África. Pode ter sido exportado da África quando profissionais haitianos visitaram Kinshasa na década de 1960 e o trouxeram para o Haiti em 1964.
  • O subtipo C é a forma dominante na África Meridional, África Oriental, Índia, Nepal e partes da China.
  • O subtipo D geralmente só é visto na África oriental e central.
  • O subtipo E é encontrado no sudeste da Ásia, que é a forma dominante para heterossexuais, pois a taxa de transmissão é muito maior do que a maioria dos outros subtipos.
  • O subtipo F foi encontrado na África Central, América do Sul e Europa Oriental.
  • O subtipo G (e o CRF02_AG) foi encontrado na África e na Europa central.
  • O subtipo H está limitado à África central.
  • O subtipo I foi originalmente usado para descrever uma cepa que agora é contabilizada como CRF04_cpx, com cpx para uma recombinação "complexa" de vários subtipos.
  • O subtipo J é encontrado principalmente na África do Norte, Central e Ocidental e no Caribe
  • O subtipo K está limitado à República Democrática do Congo (RDC) e Camarões.
  • O subtipo L está limitado à República Democrática do Congo (RDC).

O movimento espacial desses subtipos mudou-se ao longo das ferrovias e hidrovias da República Democrática do Congo (RDC) de Kinshasa para essas outras áreas. Esses subtipos às vezes são divididos em sub-subtipos como A1 e A2 ou F1 e F2. Em 2015, a cepa CRF19 , um recombinante do subtipo A, subtipo D e subtipo G, com uma protease do subtipo D , foi encontrada fortemente associada à rápida progressão para AIDS em Cuba . Esta não é considerada uma lista completa ou final, e outros tipos podem ser encontrados.

Prevalência do subtipo de HIV-1 em 2002

Grupo N

O 'N' significa "não-M, não-O". Este grupo foi descoberto por uma equipe franco-camaronesa em 1998, quando eles identificaram e isolaram a cepa variante do HIV-1, YBF380, de uma mulher camaronesa que morreu de AIDS em 1995. Quando testada, a variante YBF380 reagiu com um antígeno de envelope de SIVcpz em vez de com aqueles do Grupo M ou Grupo O, indicando que era de fato uma nova cepa de HIV-1. Em 2015, menos de 20 infecções do Grupo N foram registradas.

Grupo O

O grupo O ("Outlier") infectou cerca de 100.000 indivíduos localizados na África Centro-Ocidental e geralmente não é visto fora dessa área. É relatado mais comum em Camarões, onde uma pesquisa de 1997 descobriu que cerca de 2% das amostras HIV-positivas eram do Grupo O. Sua origem zoonótica é SIVgor, que infecta gorilas (ao invés da fonte mais comum, SIVcpz). O grupo causou alguma preocupação porque não foi detectado pelas primeiras versões dos kits de teste de HIV-1. Testes de HIV mais avançados foram desenvolvidos para detectar o Grupo O e o Grupo N.

Grupo P

Em 2009, foi relatado que uma sequência de HIV recém-analisada tinha maior semelhança com um vírus da imunodeficiência símia recentemente descoberto em gorilas selvagens (SIVgor) do que com SIVs de chimpanzés (SIVcpz). O vírus foi isolado de uma mulher camaronesa residente na França que foi diagnosticada com infecção pelo HIV-1 em 2004. Os cientistas que relataram essa sequência colocaram-no no Grupo P proposto "enquanto se aguarda a identificação de outros casos humanos".

HIV-2

O HIV-2 não foi amplamente reconhecido fora da África. A primeira identificação do HIV-2 ocorreu em 1985 no Senegal pelo microbiologista Souleymane Mboup e seus colaboradores. O primeiro caso nos Estados Unidos foi em 1987. O primeiro caso confirmado de VIH-2 foi um português que foi tratado no Hospital de Doenças Tropicais de Londres e morreu mais tarde em 1978. Acredita-se que tenha sido exposto à doença em Guiné-Bissau, onde viveu entre 1956 e 1966. Seu diagnóstico patológico na época era infecção por cryptosporidium e enterovírus, mas uma análise de seu soro armazenado em 1987 revelou que ele estava infectado com HIV-2.

Muitos kits de teste para HIV-1 também detectam o HIV-2.

Em 2010, havia oito grupos conhecidos de HIV-2 (A a H). Destes, apenas os grupos A e B são pandêmicos. O Grupo A é encontrado principalmente na África Ocidental, mas também se espalhou globalmente por Angola , Moçambique , Brasil, Índia, Europa e Estados Unidos. Apesar da presença de HIV-2 em todo o mundo, o Grupo B está confinado principalmente à África Ocidental. Apesar de seu relativo confinamento, o HIV-2 deve ser considerado em todos os pacientes que apresentam sintomas de HIV não apenas provenientes da África Ocidental, mas também de qualquer pessoa que tenha passado por qualquer transferência de fluidos corporais com uma pessoa da África Ocidental (ou seja, compartilhamento de agulhas, contato sexual, etc.).

O HIV-2 está intimamente relacionado ao vírus da imunodeficiência símia endêmica em mangabeis fuliginosos ( Cercocebus atys atys ) (SIVsmm), uma espécie de macaco que habita as florestas do litoral oeste da África. Análises filogenéticas mostram que o vírus mais intimamente relacionado às duas cepas do HIV-2 que se espalham consideravelmente em humanos (HIV-2 grupos A e B) é o SIVsmm encontrado nos mangabe fuliginosos da floresta de Tai, no oeste da Costa do Marfim .

Existem seis grupos adicionais de HIV-2 conhecidos, cada um sendo encontrado em apenas uma pessoa. Todos eles parecem derivar de transmissões independentes de mangabeys fuliginosos para humanos. Os grupos C e D foram encontrados em duas pessoas da Libéria , os grupos E e F foram encontrados em duas pessoas de Serra Leoa e os grupos G e H foram detectados em duas pessoas da Costa do Marfim. Cada uma dessas cepas de HIV-2, para as quais os humanos são provavelmente hospedeiros sem saída , está mais intimamente relacionada às cepas de SIVsmm de mangabeys fuliginosos que vivem no mesmo país onde a infecção humana foi encontrada.

Diagnóstico

O diagnóstico de HIV-2 pode ser feito quando um paciente não apresenta sintomas, mas um exame de sangue positivo indica que o indivíduo tem HIV. O Teste Rápido Multispot HIV-1 / HIV-2 é atualmente o único método aprovado pela FDA para essa diferenciação entre os dois vírus. As recomendações para o rastreamento e diagnóstico do HIV sempre foram o uso de imunoensaios enzimáticos que detectam HIV-1, HIV-1 grupo O e HIV-2. Ao rastrear a combinação, se o teste for positivo seguido por um western blot indeterminado para HIV-1 , um teste de acompanhamento, como o teste de aminoácidos , deve ser realizado para distinguir qual infecção está presente. De acordo com o NIH, um diagnóstico diferencial de HIV-2 deve ser considerado quando uma pessoa é descendente da África Ocidental ou teve contato sexual ou compartilhou agulhas com essa pessoa. A África Ocidental está em maior risco, pois é a origem do vírus.

Tratamentos

O HIV-2 é menos patogênico do que o HIV-1. O mecanismo do HIV-2 não está claramente definido, nem a diferença do HIV-1, porém a taxa de transmissão é muito menor no HIV-2 do que no HIV-1. Ambas as infecções podem levar à AIDS em indivíduos afetados e ambas podem sofrer mutação para desenvolver resistência aos medicamentos. O monitoramento da doença em pacientes com HIV-2 inclui avaliação clínica e contagens de células CD4, enquanto o tratamento inclui terapia anti-retroviral (ART), inibidores da transcriptase reversa de nucleosídeos (NRTIs), inibidores da protease (PI) e inibidores da transcriptase reversa não nucleosídeos (NNRTIs ) com a adição de antagonistas do co-receptor CCR5 e inibidores de fusão .

A escolha da terapia inicial e / ou de segunda linha para o HIV-2 ainda não foi definida. O HIV-2 parece ser resistente aos NNRTIs intrinsecamente, mas pode ser sensível aos NRTIs, embora o mecanismo seja mal compreendido. Os inibidores da protease têm mostrado efeito variável, enquanto os inibidores da integrase também estão sendo avaliados. Os regimes de combinação das terapias listadas acima também estão sendo investigados, também mostrando efeitos variáveis ​​dependendo dos tipos de terapias combinadas. Embora os mecanismos não sejam claramente compreendidos para o HIV-1 e HIV-2, sabe-se que eles usam caminhos e padrões diferentes, tornando os algoritmos usados ​​para avaliar as mutações associadas à resistência ao HIV-1 irrelevantes para o HIV-2.

Cada vírus pode ser contraído individualmente ou podem ser contraídos juntos, no que é conhecido como coinfecção. O HIV-2 parece ter taxas de mortalidade mais baixas, sintomas menos graves e progressão mais lenta para AIDS do que o HIV-1 sozinho ou a coinfecção. Na coinfecção, entretanto, isso depende muito de qual vírus foi contraído primeiro. O HIV-1 tende a superar o HIV-2 na progressão da doença. A coinfecção parece ser um problema crescente em todo o mundo com o passar do tempo, com a maioria dos casos sendo identificados em países da África Ocidental, bem como alguns casos nos EUA.

Gravidez

Se uma mãe grávida for exposta, a triagem é realizada normalmente. Se o HIV-2 estiver presente, vários medicamentos ART perinatais podem ser administrados como profilático para reduzir o risco de transmissão de mãe para filho. Depois que a criança nasce, um regime padrão de seis semanas com esses profiláticos deve ser iniciado. O leite materno também pode conter partículas de HIV-2; portanto, a amamentação é estritamente desaconselhada.

Evolução

A rápida evolução do HIV pode ser atribuída à sua alta taxa de mutação. Durante os primeiros estágios de mutação, a evolução parece ser neutra devido à ausência de uma resposta evolutiva. No entanto, ao examinar o vírus em vários indivíduos diferentes, mutações convergentes podem ser encontradas aparecendo nessas populações virais de forma independente.

A evolução do HIV dentro de um hospedeiro influencia fatores, incluindo a carga viral de ponto de ajuste do vírus . Se o vírus tiver uma carga viral de ponto de ajuste baixa, o hospedeiro viverá mais e haverá uma probabilidade maior de que o vírus seja transmitido a outro indivíduo. Se o vírus tiver uma carga viral de ponto de ajuste alto, o hospedeiro viverá por um período menor de tempo e haverá uma probabilidade menor de que o vírus seja transmitido a outro indivíduo. O HIV evoluiu para maximizar o número de infecções para outros hospedeiros, e essa tendência de seleção para favorecer cepas intermediárias mostra que o HIV passa por seleção estabilizadora.

O vírus também evoluiu para se tornar mais infeccioso entre os hospedeiros. Existem três mecanismos diferentes que permitem que o HIV evolua em nível populacional. Um inclui a batalha contínua para evoluir e superar o sistema imunológico, que retarda a evolução do HIV e muda o foco do vírus para um nível populacional. Outro inclui a evolução lenta da carga viral devido às mutações da carga viral serem neutras no hospedeiro. O último mecanismo concentra-se na preferência do vírus em transmitir cepas virais em formação armazenadas durante os estágios iniciais da infecção. Essa preferência do vírus em transmitir suas cópias armazenadas do genoma explica por que o HIV evolui mais rapidamente dentro do hospedeiro do que entre os hospedeiros.

O HIV está evoluindo para uma forma mais branda, mas está "muito longe" de não ser mais mortal.

Mutações de resistência a drogas

Isolados de HIV-1 e HIV-2 com resistência a drogas anti-retrovirais surgem por meio de seleção natural e mutações genéticas, que foram rastreadas e analisadas. O Stanford HIV Drug Resistance Database e a International AIDS Society publicam listas dos mais importantes; primeiro ano listando 80 mutações comuns, e as últimas 93 mutações comuns, e disponibilizadas através do Stanford HIV RT and Protease Sequence Database .

Veja também

Referências

links externos