SMN2 -SMN2
A sobrevivência do neurônio motor 2 ( SMN2 ) é um gene que codifica a proteína SMN (completa e truncada) em humanos.
Gene
O gene SMN2 é parte de uma duplicação invertida de 500 kb no cromossomo 5q13. Esta região duplicada contém pelo menos quatro genes e elementos repetitivos que a tornam propensa a rearranjos e deleções. A repetitividade e complexidade da sequência também têm dificultado a determinação da organização dessa região genômica. As cópias teloméricas ( SMN1 ) e centroméricas ( SMN2 ) desse gene são quase idênticas e codificam a mesma proteína. A diferença de sequência crítica entre os dois genes é um único nucleotídeo no exon 7, que se acredita ser um intensificador de splice do exon . A substituição de nucleotídeos em SMN2 resulta em cerca de 80-90% de seus transcritos em uma proteína truncada, instável e sem função biológica (Δ7SMN) e apenas 10-20% de seus transcritos sendo proteína de comprimento total (fl-SMN).
Observe que os nove exons de ambas as cópias teloméricas e centroméricas são designados historicamente como exon 1, 2a, 2b e 3-8. Pensa-se que os eventos de conversão gênica podem envolver os dois genes, levando a vários números de cópias de cada gene.
Significado clínico
Embora as mutações na cópia telomérica estejam associadas à atrofia muscular espinhal , as mutações nesse gene, a cópia centromérica, não levam à doença. Este gene pode ser um modificador da doença causada por mutação na cópia telomérica.
Referências
Leitura adicional
- Watihayati MS, Fatemeh H, Marini M, Atif AB, Zahiruddin WM, Sasongko TH, Tang TH, Zabidi-Hussin ZA, Nishio H, Zilfalil BA (janeiro de 2009). "A combinação do número de cópias SMN2 e a deleção NAIP prediz a gravidade da doença na atrofia muscular espinhal". Cérebro e desenvolvimento . 31 (1): 42–5. doi : 10.1016 / j.braindev.2008.08.012 . PMID 18842367 . S2CID 206312220 .
- Antes de TW, Krainer AR, Hua Y, Swoboda KJ, Snyder PC, Bridgeman SJ, Burghes AH, Kissel JT (setembro de 2009). "Um modificador positivo da atrofia muscular espinhal no gene SMN2" . American Journal of Human Genetics . 85 (3): 408–13. doi : 10.1016 / j.ajhg.2009.08.002 . PMC 2771537 . PMID 19716110 .
- Coady TH, Baughan TD, Shababi M, Passini MA, Lorson CL (2008). Valcarcel J (ed.). "Desenvolvimento de um sistema de vetor único que aprimora o trans-splicing de transcrições de SMN2" . PLOS ONE . 3 (10): e3468. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.3468C . doi : 10.1371 / journal.pone.0003468 . PMC 2565107 . PMID 18941511 .
- Elsheikh B, Prior T, Zhang X, Miller R, Kolb SJ, Moore D, Bradley W, Barohn R, Bryan W, Gelinas D, Iannaccone S, Leshner R, Mendell JR, Mendoza M, Russman B, Smith S, King W , Kissel JT (outubro de 2009). "Uma análise da gravidade da doença com base no número de cópias SMN2 em adultos com atrofia muscular espinhal". Músculo e nervo . 40 (4): 652–6. doi : 10.1002 / mus.21350 . PMID 19760790 . S2CID 44901599 .
- Workman E, Saieva L, Carrel TL, Crawford TO, Liu D, Lutz C, Beattie CE, Pellizzoni L, Burghes AH (junho de 2009). "Uma mutação sem sentido SMN complementa SMN2 restaurando snRNPs e resgatando ratos SMA" . Human Molecular Genetics . 18 (12): 2215–29. doi : 10.1093 / hmg / ddp157 . PMC 2685758 . PMID 19329542 .
- Bose JK, Wang IF, Hung L, Tarn WY, Shen CK (outubro de 2008). "A superexpressão de TDP-43 aumenta a inclusão do exon 7 durante a sobrevivência do splicing pré-mRNA do neurônio motor" . The Journal of Biological Chemistry . 283 (43): 28852–9. doi : 10.1074 / jbc.M805376200 . PMC 2661999 . PMID 18703504 .
- Hauke J, Riessland M, Lunke S, Eyüpoglu IY, Blümcke I, El-Osta A, Wirth B, Hahnen E (janeiro de 2009). "O silenciamento do gene 2 do neurônio motor de sobrevivência por metilação do DNA se correlaciona com a gravidade da atrofia muscular espinhal e pode ser contornado pela inibição da histona desacetilase" . Human Molecular Genetics . 18 (2): 304–17. doi : 10.1093 / hmg / ddn357 . PMC 2638778 . PMID 18971205 .
- Corcia P, Camu W, Praline J, Gordon PH, Vourch P, Andres C (2009). "A importância dos genes SMN na genética da ELA esporádica". Esclerose Lateral Amiotrófica . 10 (5–6): 436–40. doi : 10.3109 / 17482960902759162 . PMID 19922137 . S2CID 2326464 .
- Tiziano FD, Pinto AM, Fiori S, Lomastro R, Messina S, Bruno C, Pini A, Painel M, D'Amico A, Ghezzo A, Bertini E, Mercuri E, Neri G, Brahe C (janeiro de 2010). "Níveis de transcrição SMN em leucócitos de pacientes com SMA determinados por PCR em tempo real absoluto" . European Journal of Human Genetics . 18 (1): 52–8. doi : 10.1038 / ejhg.2009.116 . PMC 2987170 . PMID 19603064 .
- Jedrzejowska M, Milewski M, Zimowski J, Borkowska J, Kostera-Pruszczyk A, Sielska D, Jurek M, Hausmanowa-Petrusewicz I (2009). "Modificadores fenotípicos da atrofia muscular espinhal: o número de cópias do gene SMN2, a deleção no gene NAIP e provavelmente o gênero influenciam o curso da doença" . Acta Biochimica Polonica . 56 (1): 103–8. doi : 10.18388 / abp.2009_2521 . PMID 19287802 .
- Arkblad E, Tulinius M, Kroksmark AK, Henricsson M, Darin N (maio de 2009). "Um estudo de base populacional da variabilidade genotípica e fenotípica em crianças com atrofia muscular espinhal". Acta Paediatrica . 98 (5): 865–72. doi : 10.1111 / j.1651-2227.2008.01201.x . PMID 19154529 . S2CID 3134264 .
- Paushkin S, Gubitz AK, Massenet S, Dreyfuss G (junho de 2002). "O complexo SMN, um assemblyossomo de ribonucleoproteínas". Opinião atual em Biologia Celular . 14 (3): 305–12. doi : 10.1016 / S0955-0674 (02) 00332-0 . PMID 12067652 .
- Farooq F, Balabanian S, Liu X, Holcik M, MacKenzie A (novembro de 2009). "A proteína quinase ativada por mitógeno p38 estabiliza o mRNA de SMN através da proteína de ligação de RNA HuR" . Human Molecular Genetics . 18 (21): 4035–45. doi : 10.1093 / hmg / ddp352 . PMID 19648294 .
- Hasanzad M, Golkar Z, Kariminejad R, Hadavi V, Almadani N, Afroozan F, Salahshurifar I, Shafeghati Y, Kahrizi K, Najmabadi H (fevereiro de 2009). "Deleções no gene do neurônio motor de sobrevivência em pacientes iranianos com atrofia muscular espinhal". Anais da Academia de Medicina, Cingapura . 38 (2): 139–41. PMID 19271042 .
- Martins de Araújo M, Bonnal S, Hastings ML, Krainer AR, Valcárcel J (abril de 2009). "Reconhecimento de sítio de splice diferencial 3 'de transcrições de SMN1 e SMN2 por U2AF e U2 snRNP" . RNA . 15 (4): 515–23. doi : 10.1261 / rna.1273209 . PMC 2661831 . PMID 19244360 .
- Canção F, Qu YJ, Zou LP, Wang LW, Long MJ, Wang X, Yang YL, Chen Q, Wang H, Jin YW (dezembro de 2008). "[Análise molecular do gene do neurônio motor de sobrevivência em 338 pacientes crianças suspeitas com atrofia muscular espinhal]". Zhonghua Er Ke Za Zhi = Jornal Chinês de Pediatria . 46 (12): 919–23. PMID 19134255 .
- Irimura S, Kitamura K, Kato N, Saiki K, Takeuchi A, Matsuo M, Nishio H, Lee MJ (2009). "HnRNP C1 / C2 pode regular o splicing do exon 7 no gene de atrofia muscular espinhal SMN1". The Kobe Journal of Medical Sciences . 54 (5): E227-36. PMID 19628962 .
- Yong J, Wan L, Dreyfuss G (maio de 2004). "Por que as células precisam de uma máquina de montagem para complexos de RNA-proteína?". Trends in Cell Biology . 14 (5): 226–32. doi : 10.1016 / j.tcb.2004.03.010 . PMID 15130578 .
- Chen HH, Chang JG, Lu RM, Peng TY, Tarn WY (novembro de 2008). "A proteína de ligação de RNA hnRNP Q modula a utilização do exon 7 no gene do neurônio motor de sobrevivência 2 (SMN2)" . Molecular and Cellular Biology . 28 (22): 6929–38. doi : 10.1128 / MCB.01332-08 . PMC 2573304 . PMID 18794368 .
- Cogulu O, Durmaz B, Pehlivan S, Alpman A, Ozkinay F (junho de 2009). "Avaliação dos genes SMN e NAIP em uma família: deleção homozigótica do gene SMN2 no feto e resultado da gravidez". Teste Genético e Biomarcadores Moleculares . 13 (3): 287–8. doi : 10.1089 / gtmb.2008.0139 . PMID 19397406 .
Este artigo incorpora texto da Biblioteca Nacional de Medicina dos Estados Unidos , que é de domínio público .