PTPN22 - PTPN22

PTPN22
Estruturas Disponíveis
PDB	Pesquisa Ortholog: PDBe RCSB
Lista de códigos de id do PDB
	2P6X , 2QCJ , 2QCT , 3BRH , 3H2X , 3OLR , 3OMH , 4J51
Identificadores
Apelido	PTPN22 , proteína tirosina fosfatase, não receptor tipo 22 (linfóide), LYP, LYP1, LYP2, PEP, PTPN8, proteína tirosina fosfatase, não receptor tipo 22, PTPN22.6, PTPN22.5, proteína tirosina fosfatase tipo não receptor 22
IDs externos	OMIM : 600716 MGI : 107170 HomoloGene : 7498 GeneCards : PTPN22
Localização do gene ( humano )
Chr.	Cromossomo 1 (humano)
Fim	113.871.753 bp
Localização do gene ( mouse )
Chr.	Cromossomo 3 (mouse)
Fim	103.912.247 bp
Padrão de expressão de RNA
	; ; ; ;
	Mais dados de expressão de referência
Ontologia do gene
Função molecular	• fosfoproteína fosfatase actividade ; • domínio de ligação SH3 ; • actividade fosfatase ; • ligação da quinase ; • GO: 0001948 protea de ligao ; • actividade hidrolase ; • proteína ubiquitina-ligase de ligação ; • actividade da proteína tirosina fosfatase ;
Componente celular	• citoplasma ; • região perinuclear do citoplasma ; • lado citoplasmático da membrana plasmática ; • núcleo da célula ; • citosol ;
Processo biológico	• regulação positiva da ubiquitinação ligada à proteína K63 ; • regulação da sinalização NIK / NF-kappaB ; • regulação da resposta imune inata ; • regulação da proliferação de células natural killer ; • regulação positiva da via de sinalização do receptor 3 semelhante a toll ; • regulação da via de sinalização do receptor de células T ; • regulação da via de sinalização do receptor de células B ; • desfosforilação fosfoanandamida ; • processo do sistema imunológico ; • regulação negativa do domínio de oligomerização de ligação de nucleotídeos contendo 2 vias de sinalização ; • regulação negativa da cascata p38MAPK ; • desfosforilação de proteínas ; • regulação negativa da expressão gênica ; • regulação negativa do receptor de células T via de sinalização ; • resposta celular ao dipeptídeo muramil ; • autofagia ; • resposta ao lipopolissacarídeo ; • Diferenciação de células T ; • regulação positiva da expressão gênica ; • regulação positiva da cascata ERK1 e ERK2 ; • regulação positiva da via de sinalização do receptor toll-like 4 ; • regulação negativa do fator de necrose tumoral productio n ; • regulação negativa da autofagia ; • regulação negativa da atividade da JUN quinase ; • regulação negativa da ativação das células T ; • regulação positiva da produção de interferon tipo I ; • via de sinalização mediada por lipopolissacarídeos ; • desfosforilação ; • desfosforilação de peptidil-tirosina ; • Via de sinalização do receptor de células T ;
	Fontes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	26191
	19260
	ENSG00000134242
	ENSMUSG00000027843
	Q9Y2R2
	P29352
	NM_001193431 ; NM_001308297 ; NM_012411 ; NM_015967
	NM_008979
	NP_001180360 ; NP_001295226 ; NP_036543 ; NP_057051
	NP_033005
	Wikidata
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A proteína tirosina fosfatase, não receptor tipo 22 (linfóide) , também conhecida como PTPN22 , é uma proteína que em humanos é codificada pelo gene PTPN22 . Este gene pode ser expresso em diferentes formas . O PTPN22 afeta a responsividade dos receptores das células T e B, e as mutações estão associadas a aumentos ou diminuições nos riscos de doenças autoimunes.

Biologia molecular

O gene está localizado no braço curto do cromossomo 1 próximo ao centrômero (1p13.2) na fita de Crick (menos) . Tem 57.898 bases de comprimento e codifica uma proteína de 807 aminoácidos (peso molecular 91.705 Da). Existem 24 exons no gene e 21 variantes de transcrição que codificam 10 proteínas distintas são conhecidas. As proteínas estão localizadas no citoplasma .

Função

Este gene codifica uma proteína tirosina fosfatase que é expressa principalmente em tecidos linfóides . Esta enzima está envolvida em várias vias de sinalização associadas à resposta imune. Com base em modelos de fosfatase murina, identificação estrutural e genética humana, a fosfatase forma complexos com tirosina quinase C-src (Csk), associados ao controle de membros da família Src. A mutação Arg620Trp interrompe a ligação ao Csk, altera a capacidade de resposta dos receptores das células T e B e está associada a doenças autoimunes. Existem outras sugestões de que a fosfatase regula a função CBL na via de sinalização do receptor de células T. Outras interações são prováveis.

Associação de doenças

O polimorfismo de nucleotídeo único comum 1858T (rs2476601) Arg620Trp localizado no gene PTPN22 foi associado a doenças autoimunes, incluindo um risco aumentado de diabetes tipo 1 , artrite reumatóide , lúpus , vitiligo e doença de Graves , mas um risco reduzido de doença de Crohn .

Um estudo recente sugere que a mutação não reduz, em termos populacionais, a expectativa de vida. A mutação pode ser conservada na evolução humana porque pode fornecer uma resposta hiperimune a doenças infecciosas.

Mutações em PTPN22 são super-representadas no câncer de mama .

Referências

Leitura adicional

Gregersen PK (2005). "Caminhos para a identificação do gene na artrite reumatóide: PTPN22 e além". Immunol. Rev . 204 : 74–86. doi : 10.1111 / j.0105-2896.2005.00243.x . PMID 15790351 . S2CID 30275010 .
Brand O, Gough S, Heward J (2005). "HLA, CTLA-4 e PTPN22: a chave mestra genética compartilhada para a autoimunidade?". Especialista Rev Mol Med . 7 (23): 1–15. doi : 10.1017 / S1462399405009981 . PMID 16229750 .
Bottini N, Vang T, Cucca F, Mustelin T (2006). "Papel do PTPN22 na diabetes tipo 1 e outras doenças auto-imunes". Semin. Immunol . 18 (4): 207–13. doi : 10.1016 / j.smim.2006.03.008 . PMID 16697661 .
Gjörloff-Wingren, A .; Saxena, M .; Han, S .; Wang, X .; Alonso, A .; Renedo, M .; Oh, P .; Williams, S .; Schnitzer, J .; Mustelin, T. (2000). "Subcellular localization of intracelular protein tyrosine phosphatases in T cells". European Journal of Immunology . 30 (8): 2412–2421. doi : 10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2412 :: AID-IMMU2412> 3.0.CO; 2-J . PMID 10940933 .
Hill RJ, Zozulya S, Lu YL, Ward K, Gishizky M, Jallal B (2002). "A proteína linfoide tirosina fosfatase Lyp interage com a molécula adaptadora Grb2 e funciona como um regulador negativo da ativação de células T". Exp. Hematol . 30 (3): 237–44. doi : 10.1016 / S0301-472X (01) 00794-9 . PMID 11882361 .
Chien W, Tidow N, Williamson EA, Shih LY, Krug U, Kettenbach A, Fermin AC, Roifman CM, Koeffler HP (2003). "Caracterização de uma tirosina fosfatase mieloide, Lyp, e seu papel na via de transdução de sinal Bcr-Abl" . J. Biol. Chem . 278 (30): 27413–20. doi : 10.1074 / jbc.M304575200 . PMID 12764153 .
Bottini N, Musumeci L, Alonso A, Rahmouni S, Nika K, Rostamkhani M, MacMurray J, Meloni GF, Lucarelli P, Pellecchia M, Eisenbarth GS, Comings D, Mustelin T (2004). "Uma variante funcional da tirosina fosfatase linfóide está associada ao diabetes tipo I" . Nat. Genet . 36 (4): 337–8. doi : 10.1038 / ng1323 . PMID 15004560 .
Begovich AB, Carlton VE, Honigberg LA, Schrodi SJ, Chokkalingam AP, Alexander HC, Ardlie KG, Huang Q, Smith AM, Spoerke JM, Conn MT, Chang M, Chang SY, Saiki RK, Catanese JJ, Leong DU, Garcia VE , McAllister LB, Jeffery DA, Lee AT, Batliwalla F, Remmers E, Criswell LA, Seldin MF, Kastner DL, Amos CI, Sninsky JJ, Gregersen PK (2004). "Um polimorfismo missense de nucleotídeo único em um gene que codifica uma proteína tirosina fosfatase (PTPN22) está associado à artrite reumatóide" . Sou. J. Hum. Genet . 75 (2): 330–7. doi : 10.1086 / 422827 . PMC 1216068 . PMID 15208781 .
Kyogoku C, Langefeld CD, Ortmann WA, Lee A, Selby S, Carlton VE, Chang M, Ramos P, Baechler EC, Batliwalla FM, Novitzke J, Williams AH, Gillett C, Rodine P, Graham RR, Ardlie KG, Gaffney PM , Moser KL, Petri M, Begovich AB, Gregersen PK, Behrens TW (2004). "Associação genética do polimorfismo R620W da proteína tirosina fosfatase PTPN22 com SLE humano" . Sou. J. Hum. Genet . 75 (3): 504–7. doi : 10.1086 / 423790 . PMC 1182029 . PMID 15273934 .
Smyth D, Cooper JD, Collins JE, Heward JM, Franklyn JA, Howson JM, Vella A, Nutland S, Rance HE, Maier L, Barratt BJ, Guja C, Ionescu-Tîrgoviste C, Savage DA, Dunger DB, Widmer B, Strachan DP, Ring SM, Walker N, Clayton DG, Twells RC, Gough SC, Todd JA (2004). "Replicação de uma associação entre o locus tirosina fosfatase linfóide (LYP / PTPN22) com diabetes tipo 1, e evidências de seu papel como um locus de autoimunidade geral" . Diabetes . 53 (11): 3020–3. doi : 10.2337 / diabetes.53.11.3020 . PMID 15504986 .
Ladner MB, Bottini N, Valdes AM, Noble JA (2005). "Associação do polimorfismo de nucleotídeo único C1858T do gene PTPN22 com diabetes tipo 1". Zumbir. Immunol . 66 (1): 60–4. doi : 10.1016 / j.humimm.2004.09.016 . PMID 15620463 .
Orozco G, Sánchez E, González-Gay MA, López-Nevot MA, Torres B, Cáliz R, Ortego-Centeno N, Jiménez-Alonso J, Pascual-Salcedo D, Balsa A, de Pablo R, Nuñez-Roldan A, González -Escribano MF, Martín J (janeiro de 2005). "Associação de um polimorfismo funcional de nucleotídeo único de PTPN22, que codifica a proteína fosfatase linfóide, com artrite reumatóide e lúpus eritematoso sistêmico" . Arthritis Rheum . 52 (1): 219–24. doi : 10.1002 / art.20771 . PMID 15641066 .
Steer S, Lad B., Grumley JA, Kingsley GH, Fisher SA (2005). "Associação de R602W em um gene de proteína tirosina fosfatase com alto risco de artrite reumatóide em uma população britânica: evidência de um início precoce / efeito de gravidade da doença" . Arthritis Rheum . 52 (1): 358–60. doi : 10.1002 / art.20737 . PMID 15641088 .
Zheng W, She JX (2005). "Associação genética entre uma tirosina fosfatase linfóide (PTPN22) e diabetes tipo 1" . Diabetes . 54 (3): 906–8. doi : 10.2337 / diabetes.54.3.906 . PMID 15734872 .
Zhernakova A, Eerligh P, Wijmenga C, Barrera P, Roep BO, Koeleman BP (2005). "Associação diferencial da variante de codificação PTPN22 com doenças auto-imunes em uma população holandesa" . Genes Immun . 6 (6): 459–61. doi : 10.1038 / sj.gene.6364220 . PMID 15875058 .

links externos

Visão geral de todas as informações estruturais disponíveis no PDB para UniProt : Q9Y2R2 (não receptor de tirosina-proteína fosfatase tipo 22) no PDBe-KB .

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