Haplogrupo L0 (mtDNA) - Haplogroup L0 (mtDNA)
Haplogrupo L0 | |
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Possível hora de origem | 130 a 200 ka |
Possível local de origem | África do Sul ou Sul da África Oriental |
Antepassado | L ( Eva Mitocondrial ) |
Descendentes | L0a'b'f'k, L0d |
Definindo mutações | 263 !, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720 |
O haplogrupo L0 é um haplogrupo de DNA mitocondrial humano (mtDNA).
Origem
L0 é um dos dois ramos do ancestral comum mais recente (MRCA) para a linhagem materna humana compartilhada. O haplogrupo consiste em cinco ramos principais (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Quatro deles foram originalmente classificados em subclados L1, L1a, L1d, L1f e L1k.
Em 2014, uma análise de DNA antigo do esqueleto de um forrageador macho de 2.330 anos na África do Sul descobriu que o espécime pertencia ao subclado L0d2c1c mtDNA. Esse haplogrupo materno é hoje o mais associado aos Ju, um subgrupo do povo indígena San , o que aponta para a continuidade populacional na região. Em 2016, descobriu-se que uma múmia desidratada da Idade do Ferro da região de Tuli, no norte de Botswana, também pertencia ao haplogrupo L0.
MRCA (mtDNA) |
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Distribuição
L0 é encontrado mais comumente na África Subsaariana . Atinge sua maior frequência no povo Khoisan com 73% em média. Algumas das frequências mais altas são: Namíbia ( ! Xun ) 79%, África do Sul ( Khwe /! Xun) 83% e Botswana ( ! Kung ) 100%.
O Haplogrupo L0d é encontrado entre os grupos Khoisan da África do Sul mais perto do lado Khoid com (seguindo L0k) sendo mais Sanid, mas é amplamente restrito ao Khoisan como um todo. L0d também é comumente encontrado na população de cor da África do Sul e as frequências variam de 60% a 71%. Isso ilustra a enorme contribuição materna do povo Khoisan para a população de cor da África do Sul.
Haplogrupos L0k é o segundo haplogrupo mais comum nos grupos Khoisan mais perto do lado Sanid com (seguindo L0d) sendo mais Khoid, mas é amplamente restrito ao Khoisan como um todo. Embora o haplogrupo L0d associado a Khoisan tenha sido encontrado em altas frequências na população de cor da África do Sul, L0k não foi observado em dois estudos envolvendo grandes grupos de indivíduos de cor.
O Haplogrupo L0f está presente em frequências relativamente pequenas na Tanzânia , África Oriental , entre o povo Sandawe da Tanzânia que é mais velho do que os Khoisan.
O haplogrupo L0a é mais prevalente nas populações do Sudeste Africano (25% em Moçambique ). Entre os guineenses , tem uma frequência entre 1% e 5%, com o grupo Balanta a apresentar um aumento de frequência na ordem dos 11%. O Haplogrupo L0a tem uma profundidade de tempo Paleolítico de cerca de 33.000 anos e provavelmente atingiu a Guiné entre 10.000 e 4.000 anos atrás. Também é freqüentemente visto nos pigmeus Mbuti e Biaka . L0a é encontrado com uma frequência de quase 25% em Hadramawt ( Iêmen ).
O haplogrupo L0b é encontrado na Etiópia .
Interações de drogas e doenças
Em pacientes que recebem o medicamento estavudina para tratar o HIV , o Haplogrupo L0a2 está associado a uma maior probabilidade de neuropatia periférica como efeito colateral.
Subclades
Árvore
Esta árvore filogenética dos subclados L0 do haplogrupo é baseada no artigo de Mannis van Oven e Manfred Kayser. Árvore filogenética abrangente atualizada da variação do DNA mitocondrial humano global e subsequente pesquisa publicada.
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Ancestral Comum Mais Recente (MRCA)
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L0
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L0d
- L0d3
- L0d1'2
- L0d1
- L0d1a
- L0d1b
- L0d1c
- L0d1c1
- L0d2
- L0d2a'b
- L0d2a
- L0d2a1
- L0d2b
- L0d2a
- L0d2c
- L0d2c1c
- L0d2a'b
- L0d1
- L0a'b'f'k
-
L0k
- L0k1
- L0k2
- L0a'b'f
-
L0f
- L0f1
- L0f2
- L0f2a
- L0f2b
- L0a'b
-
L0a
- L0a1
- L0a1a
- L0a1a2
- L0a1b
- L0a1b1
- L0a1b1a
- L0a1b2
- L0a1b1
- L0a1c
- L0a1d
- L0a1a
- L0a2
- L0a2a
- L0a2a1
- L0a2a1a
- L0a2a1a1
- L0a2a1a2
- L0a2a1a
- L0a2a2
- L0a2a2a
- L0a2a1
- L0a2b
- L0a2ba
- L0a2c
- L0a2d
- L0a2a
- L0a3
- L0a4
- L0a1
- L0b
-
L0a
-
L0f
-
L0k
-
L0d
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L0
Veja também
- Teste de DNA genealógico
- Genealogia genética
- Genética mitocondrial humana
- Genética de População
- Haplogrupos de DNA mitocondrial humano
Árvore filogenética de haplogrupos de DNA mitocondrial humano (mtDNA) |
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Eva mitocondrial ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | O | UMA | S | R | eu | C | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pré-JT | P | você | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
H | V | J | T |
Referências
links externos
- Em geral
- Site de DNA mitocondrial de Ian Logan
- Phylotree de Mannis van Oven
- Haplogrupo L0
- L0 YFull MTree 1.02.00 (em construção)
-
Rosa, Alexandra; Brehm, Antonio; Kivisild, Toomas; Metspalu, Ene; Villems, Richard (2004). "Perfil do MtDNA dos guineenses da África Ocidental: Rumo a uma melhor compreensão da região da Senegâmbia". Annals of Human Genetics . 68 (4): 340–52. doi : 10.1046 / j.1529-8817.2004.00100.x . hdl : 10400.13 / 3044 . PMID 15225159 . S2CID 15391342 .
Com base no conhecimento prévio de sequências completas africanas, o clado parafilético L1 é dividido em duas unidades monofiléticas L0, capturando as linhagens L1a e L1d previamente definidas e o clado L1 que inclui os clados L1b e L1c ...
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Pavesi, A. (2005). "Utilidade do poliomavírus JC no rastreamento do padrão de migrações humanas que datam de tempos pré-históricos" . Journal of General Virology . 86 (5): 1315–26. doi : 10.1099 / vir.0.80650-0 . PMID 15831942 .
O primeiro eixo do mtDNA, por outro lado, coloca o haplogrupo ancestral L0 na extrema esquerda, pois deu origem a uma única linhagem ...
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Mishmar, Dan; Ruiz-Pesini, Eduardo; Brandon, Martin; Wallace, Douglas C. (2004). "Sequências semelhantes a DNA mitocondrial no núcleo (NUMTs): Insights sobre nossas origens africanas e o mecanismo de integração de DNA estranho". Mutação Humana . 23 (2): 125–33. doi : 10.1002 / humu.10304 . PMID 14722916 . S2CID 25109836 .
mtDNAs L0 do haplogrupo, o haplogrupo que concluímos anteriormente está na base do mtDNA humano. árvore com base na análise filogenética ...
- Knight, Alec; Underhill, Peter A .; Mortensen, Holly M .; Zhivotovsky, Lev A .; Lin, Alice A .; Henn, Brenna M .; Louis, Dorothy; Ruhlen, Merritt; Mountain, Joanna L. (2003). "African Y Chromosome and mtDNA Divergence Provides Insight on the History of Click Languages" . Biologia atual . 13 (6): 464–73. doi : 10.1016 / S0960-9822 (03) 00130-1 . PMID 12646128 . S2CID 52862939 .