Cromossomo 21 - Chromosome 21

Cromossomo 21
Cariote humano masculino em alta resolução - Cromossomo 21 cropped.png
Cromossoma humano 21 par depois L-bandas .
Um é da mãe, outro é do pai.
Cariote humano masculino de alta resolução - Cromossomo 21.png
Par do cromossomo 21
no cariograma masculino humano .
Recursos
Comprimento ( bp ) 46.709.983 bp
( GRCh38 )
No. de genes 215 ( CCDS )
Modelo Autossomo
Posição do centrômero Acrocêntrico
(12,0 Mbp)
Listas completas de genes
CCDS Lista de genes
HGNC Lista de genes
UniProt Lista de genes
NCBI Lista de genes
Visualizadores de mapa externos
Conjunto Cromossomo 21
Entrez Cromossomo 21
NCBI Cromossomo 21
UCSC Cromossomo 21
Sequências completas de DNA
RefSeq NC_000021 ( FASTA )
GenBank CM000683 ( FASTA )

O cromossomo 21 é um dos 23 pares de cromossomos em humanos . O cromossomo 21 é o menor autossomo e cromossomo humano , com 48 milhões de pares de bases (o material de construção do DNA ) representando cerca de 1,5 por cento do DNA total nas células . A maioria das pessoas tem duas cópias do cromossomo 21, enquanto aquelas com três cópias do cromossomo 21 têm síndrome de Down , também chamada de "trissomia 21".

Pesquisadores que trabalham no Projeto Genoma Humano anunciaram em maio de 2000 que haviam determinado a sequência de pares de bases que compõem esse cromossomo. O cromossomo 21 foi o segundo cromossomo humano a ser totalmente sequenciado, após o cromossomo 22 .

Genes

Número de genes

A seguir estão algumas das estimativas de contagem de genes do cromossomo 21 humano. Como os pesquisadores usam diferentes abordagens para a anotação do genoma, suas previsões do número de genes em cada cromossomo variam (para obter detalhes técnicos, consulte previsão de genes ). Entre vários projetos, o projeto de sequência de codificação de consenso colaborativo ( CCDS ) adota uma estratégia extremamente conservadora. Portanto, a previsão do número do gene do CCDS representa um limite inferior no número total de genes codificadores de proteínas humanas.

Estimado por Genes codificadores de proteínas Genes de RNA não codificantes Pseudogenes Fonte Data de lançamento
CCDS 215 - - 08/09/2016
HGNC 217 165 180 12/05/2017
Conjunto 234 404 183 29-03-2017
UniProt 252 - - 28/02/2018
NCBI 256 356 207 19/05/2017

Lista de genes

A seguir está uma lista parcial de genes do cromossomo 21 humano. Para obter a lista completa, consulte o link na caixa de informações à direita.

  • ADAMTS1
  • APP : proteína precursora de beta amilóide (A4) (peptidase nexin-II, doença de Alzheimer)
  • C21orf62 : expresso em tecidos do cérebro e órgãos reprodutivos
  • CBR1 : codificação da enzima carbonil redutase [NADPH] 1
  • CBR3 : codificação da enzima carbonil redutase [NADPH] 3
  • CBS : cistationina-beta-sintase
  • CFAP298 : codificando a proteína 298 associada a cílios e flagelos
  • CLDN14 : claudina 14
  • CRYZL1 : Cristalina tipo zeta 1
  • CYYR1 : rico em cisteína e tirosina 1
  • DIP2A : homólogo A de proteína 2 que interage com disco
  • DNAJC28 : codificando a proteína DnaJ homóloga da subfamília C membro 28
  • DOPEY2 : Membro da família Dunga 2
  • DSCR1 : região crítica 1 da Síndrome de Down
  • DYRK1A : quinase 1A regulada por tirosina (Y) -fosforilação de especificidade dupla
  • ERG
  • ETS2
  • FAM3B : Família com similaridade de sequência 3 membro B
  • FRGCA : proteína codificadora regulada por FOXM1, câncer gástrico associado
  • GATD3A : que codifica a proteína 3A contendo domínio de classe 1 semelhante a glutamina amidotransferase, mitocondrial
  • HLCS : holocarboxilase sintetase (biotina- (propionil-Coenzima A-carboxilase (ATP-hidrólise)) ligase)
  • KCNE1 : canal controlado por voltagem de potássio, família relacionada a Isk, membro 1
  • KCNE2 : canal controlado por voltagem de potássio, família relacionada a Isk, membro 2
  • LAD : deficiência de adesão de leucócitos (os símbolos são ITGB2, CD18, LCAMB)
  • MIS18A : proteína codificadora da proteína Mis18-alfa
  • NRIP1
  • OLIG2
  • PAXBP1 : que codifica a proteína GC-rich homólogo factor de sequência de ADN de ligao
  • PCNT : pericentrina centrossomal
  • PDXK : codificação da enzima piridoxal quinase
  • PSMG1 : Proteasome assembly chaperone 1
  • RNR4 : RNA, cluster ribossomal 45S 4
  • RRP1 : proteína codificadora de proteína de processamento de RNA ribossomal 1 homólogo A
  • RRP1B : RNA ribossomal processando 1 homólogo B
  • RWDD2B : proteína que codifica o domínio RWD contendo a proteína 2B
  • RUNX1
  • S100B : proteína de ligação de cálcio
  • SOD1 : superóxido dismutase 1, solúvel (esclerose lateral amiotrófica 1 (adulto))
  • SPATC1L : codificando a proteína SPATC1L
  • TFF1 , TFF2 , TFF3
  • TIAM1
  • TMEM1 : codificando proteína Subunidade 10 do complexo de partículas de proteína de tráfico
  • TMPRSS2
  • TMPRSS3 : protease transmembrana, serina 3
  • TTC3 : Domínio 3 de repetição de tetratricopeptídeo

Doenças e distúrbios

As seguintes doenças e distúrbios são alguns daqueles relacionados aos genes no cromossomo 21:

Condições cromossômicas

Cariótipo de alguém afetado com síndrome de Down, representando a presença de uma cópia adicional completa do cromossomo 21. A presença dessa cópia extra também é conhecida como Trissomia 21.

As seguintes condições são causadas por mudanças na estrutura ou número de cópias do cromossomo 21:

  • Cânceres : rearranjos ( translocações ) de material genético entre o cromossomo 21 e outros cromossomos foram associados a vários tipos de câncer. Por exemplo, a leucemia linfoblástica aguda (um tipo de câncer de sangue mais frequentemente diagnosticado na infância) foi associada a uma translocação entre os cromossomos 12 e 21. Outra forma de leucemia, a leucemia mieloide aguda , foi associada a uma translocação entre os cromossomos 8 e 21 .
  • Em uma pequena porcentagem dos casos, a síndrome de Down é causada por um rearranjo do material cromossômico entre o cromossomo 21 e outro cromossomo. Como resultado, uma pessoa tem as duas cópias normais do cromossomo 21, mais o material extra do cromossomo 21 ligado a outro cromossomo. Esses casos são chamados de síndrome de Down de translocação. Os pesquisadores acreditam que cópias extras de genes no cromossomo 21 interrompem o curso do desenvolvimento normal, causando as características da síndrome de Down e o aumento do risco de problemas médicos associados a esse distúrbio.
  • Outras mudanças no número ou estrutura do cromossomo 21 podem ter uma variedade de efeitos, incluindo deficiência intelectual , atraso no desenvolvimento e características faciais. Em alguns casos, os sinais e sintomas são semelhantes aos da síndrome de Down. As alterações no cromossomo 21 incluem um segmento ausente do cromossomo em cada célula (monossomia parcial 21) e uma estrutura circular chamada cromossomo 21 em anel. Um cromossomo em anel ocorre quando ambas as extremidades de um cromossomo quebrado são reunidas.
  • A duplicação no locus da proteína precursora de amilóide (APP) (segmento duplicado varia em comprimento, mas inclui APP) no cromossomo 21 foi encontrada para causar doença de Alzheimer familiar de início precoce em um conjunto de família francesa (Rovelet-Lecrux et al.) E um conjunto de família holandesa. Comparado ao Alzheimer causado por mutações missense em APP, a frequência do Alzheimer causado por duplicações de APP é significativa. Todos os pacientes que possuem uma cópia extra do gene APP devido à duplicação do locus apresentam Alzheimer com angiopatia amilóide cerebral grave .

Banda citogenética

Ideogramas de banda G do cromossomo 21 humano
Ideograma de banda G do cromossomo 21 humano na resolução de 850 bphs. O comprimento da banda neste diagrama é proporcional ao comprimento do par de bases. Este tipo de ideograma é geralmente usado em navegadores de genoma (por exemplo , Ensembl , UCSC Genome Browser ).
Padrões de banda G do cromossomo 21 humano em três resoluções diferentes (400, 550 e 850). O comprimento da banda neste diagrama é baseado nos ideogramas de ISCN (2013). Este tipo de ideograma representa o comprimento de banda relativo real observado ao microscópio em diferentes momentos durante o processo mitótico .
Bandas G do cromossomo 21 humano na resolução de 850 bphs
Chr. Braço Banda ISCN
start

Parada ISCN
Basepair
início

Parada do basepair
Mancha Densidade
21 p 13 0 311 1 3.100.000 gvar
21 p 12 311 683 3.100.001 7.000.000 talo
21 p 11,2 683 1056 7.000.001 10.900.000 gvar
21 p 11,1 1056 1274 10.900.001 12.000.000 acen
21 q 11,1 1274 1367 12.000.001 13.000.000 acen
21 q 11,2 1367 1584 13.000.001 15.000.000 gneg
21 q 21,1 1584 2019 15.000.001 22.600.000 gpos 100
21 q 21,2 2019 2144 22.600.001 25.500.000 gneg
21 q 21,3 2144 2330 25.500.001 30.200.000 gpos 75
21 q 22,11 2330 2485 30.200.001 34.400.000 gneg
21 q 22,12 2485 2610 34.400.001 36.400.000 gpos 50
21 q 22,13 2610 2703 36.400.001 38.300.000 gneg
21 q 22,2 2703 2858 38.300.001 41.200.000 gpos 50
21 q 22,3 2858 3200 41.200.001 46.709.983 gneg

Referências

  • Antonarakis SE, Lyle R, Dermitzakis ET, Reymond A, Deutsch S (2004). "Cromossomo 21 e síndrome de down: da genômica à fisiopatologia". Nat Rev Genet . 5 (10): 725–38. doi : 10.1038 / nrg1448 . PMID  15510164 . S2CID  5487794 .
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links externos

  • Instituto Nacional de Saúde. "Cromossoma 21" . Referência de Genetics Home . Arquivado do original em 05/06/2011 . Recuperado em 06-05-2017 .
  • "Cromossomo 21" . Arquivo de informações do projeto do genoma humano 1990–2003 . Recuperado em 06-05-2017 .