RNA ribossômico 28S - 28S ribosomal RNA
O RNA ribossômico 28S é o RNA ribossômico estrutural (rRNA) da subunidade grande (LSU) dos ribossomos citoplasmáticos eucarióticos e, portanto, um dos componentes básicos de todas as células eucarióticas. Tem um tamanho de 25S em plantas e 28S em mamíferos, daí o apelido de 25S – 28S rRNA .
Combinado com 5.8S rRNA para o lado 5 ', é o homólogo nuclear eucariótico dos RNAs ribossômicos 23S procarióticos e mitocondriais 16S .
Uso na filogenia
Os genes que codificam para 28S rRNA são referidos como 28S rDNA. A comparação das sequências desses genes às vezes é usada em análise molecular para construir árvores filogenéticas , por exemplo, em protistas , fungos , insetos , tardígrados e vertebrados .
Estrutura
O 28S rRNA tem tipicamente 4000–5000 nt de comprimento.
Alguns eucariotos clivam 28S rRNA em duas partes antes de montar ambas no ribossomo, um fenômeno denominado "quebra oculta".
Bancos de dados
Vários bancos de dados fornecem alinhamentos e anotações de sequências de rRNA LSU para fins comparativos :
- RDP, o Projeto de Banco de Dados Ribossômico;
- SILVA, um projeto de banco de dados de genes de RNA ribossomal.